2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします
現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです
NBDC ヒトデータベース申請業務ならびにJGA関係の業務につきまして、以下の期間休業いたします：2026年8月12日(水) 〜 2026年8月17日(月) 休業期間中にいただいた申請やお問い合わせ等は、休業明けの 8月18日(火) より順次対応させていただきます。 上記休業期間の前後は通常より対応が遅れることがあります。予めご了承ください。 ご迷惑をおかけいたしますが、ご理解とご協力をお願いいたします。
目的: 乳がん幹細胞のゲノム解析およびシングルセル解析を用いた乳がんにおける不均一変異の解明
研究方法: 乳がん症例の腫瘍組織や、当該腫瘍組織を免疫不全マウスに移植したPatient-derived xenograft (PDX) モデルにおいて増殖した腫瘍組織からDNA/RNAを抽出し、whole exome sequencing (Exome) / RNA-seq解析を実施
対象: 乳がん 5症例 (scRNA-seq: 4症例11検体、Exome: 5症例12検体)
データセット ID | アクセス制限 | データの種類 | 公開日 | |
|---|---|---|---|---|
| JGAD000415 | 制限公開（Type I） | NGS(Exome) | 2022-07-19 | |
| JGAD000416 | 制限公開（Type I） | NGS(scRNA-seq) | 2022-07-19 | |
研究プロジェクト名 | URL |
|---|---|
| データなし | |
科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
|---|---|---|
| 科学研究費助成事業 新学術領域研究 | 先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム |
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タイトル | DOI | データセット |
|---|---|---|
| Addiction to the IGF2-ID1-IGF2 circuit for maintenance of the breast cancer stem-like cells. | https://doi.org/10.1038/onc.2016.293 | |
| Semaphorin signaling via MICAL3 induces symmetric cell division to expand breast cancer stem-like cells. | https://doi.org/10.1073/pnas.1806851116 | |
研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | データ利用期間 | 利用データID |
|---|---|---|---|---|---|
| データなし | |||||