データセット ID
JGAD000415
- データの種類
- NGS（Exome）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 199 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0278
- 公開日
- 2022-07-19
- 更新日
- 2022-07-19
- DDBJ Search
- JGAD000415 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000304 (新しいタブで開きます)
解析手法
WES
- 材料と対象者
- 乳がん（ICD10：C509）：5症例
腫瘍組織：12検体 （乳がん幹細胞、乳がん非幹細胞） - 健康状態罹患
- 対象者数5 (人数)
- 疾患
- 乳がん (C509)
- 試料説明
- 乳がん幹細胞マーカーにより分画した乳がん幹細胞および乳がん非幹細胞のそれぞれから抽出したDNA
- 組織Breast cancer non-stem cell、Breast cancer stem cell
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- SureSelect Human All Exon V5
- 断片化
- 超音波断片化 （Covaris）
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 3000
Illumina NovaSeq 6000 - リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- HiSeq: 200 bp (PE合計(100PE))
NovaSeq: 300 bp (PE合計(150PE))