データセット ID
JGAD000416
- データの種類
- NGS（scRNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 333 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0278
- 公開日
- 2022-07-19
- 更新日
- 2022-07-19
- DDBJ Search
- JGAD000416 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000305 (新しいタブで開きます)
解析手法
scRNA-seq
- 材料と対象者
- 乳がん（ICD10：C509）：4症例
腫瘍組織：11検体 （乳がん幹細胞） - 健康状態罹患
- 対象者数4 (人数)
- 疾患
- 乳がん (C509)
- 試料説明
- 乳がん幹細胞マーカーにより分画した乳がん幹細胞から1細胞ごとに抽出したRNA
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- scRNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Nextera XT DNA Library Prep Kit
- 断片化
- Tagmentation （Nextera XT DNA Sample Preparation Kit）
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 3000
- リードタイプ
- 混在
- リード長
- 50 bp (SR)
200 bp (PE合計(100PE))