システムメンテナンスに伴い、以下の日程で、NBDCヒトデータベース申請システムならびにヒトデータ審査委員会による審査が停止いたします。
停止期間：2026年10月5日(月) 9:00 ～ 10月7日(水) 15:00
ご迷惑をおかけしますが、どうぞ宜しくお願いいたします。

現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

研究 ID

hum0252-v2リリース情報

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最新バージョン (v3)

研究題目

ATL、HTLV-1感染症の分子基盤創出のための研究

研究概要

目的: 成人T 細胞白血病（ATL）の遺伝子変異と遺伝子発現の解析を通じてATLのリスクバイオマーカーと発症メカニズムを明らかにする。Target capture sequencingを用いて成人T細胞白血病（ATL）の遺伝子変異とクローン構造を解析し、さらにRNA sequencingによって遺伝子変異の生物学的意義を検討する。
研究方法: Target capture sequencing、RNA sequencing（RNA-seq）、single cell RNA sequencing（scRNA-seq）、Whole genome sequencing（WGS）、scATAC-seq、ChIP-seq
対象: ATL6＋4＋6症例、及びHTLV-1感染者10症例の感染細胞分画及び非感染細胞分画、並びに健常者3＋1名のCD4+T細胞（Lonzaからの購入検体）
URL: N/A

データセット

データセットの一覧はこのバージョンのものですが、各データセットの内容は現在のものを表示しています。

カート	データセット ID	データの種類	解析手法	アクセス制限	公開日
	JGAD000412	NGS（Target Capture、RNA-seq、scRNA-seq）	Targeted DNA sequencing scRNA-seq RNA-seq	制限公開（Type I）	2021-06-30
	JGAD000674	NGS（Target Capture、WGS、scRNA-seq、scATAC-seq、ChIP-seq）	Targeted DNA sequencing scRNA-seq WGS	制限公開（Type I）	2023-12-06

提供者

研究代表者: 山岸誠
所属機関: 東京大学大学院新領域創成科学研究科

研究プロジェクト情報

研究プロジェクト情報はありません。

助成金情報

科研費・助成金名	研究課題名	研究課題番号
日本医療研究開発機構（AMED）新興・再興感染症に対する革新的医薬品等開発推進研究事業	ゲノム情報を基盤としたHTLV-1感染症の病態形成機序の解明及び発症リスク予知アルゴリズム開発に関する総合的研究	JP23fk0108672
日本医療研究開発機構（AMED）新興・再興感染症に対する革新的医薬品等開発推進研究事業	HTLV-1関連疾患の発症リスク、進展メカニズムに関するオミックス統合解析と発症予防に資する基盤的研究	JP22fk0108126
日本医療研究開発機構（AMED）新興・再興感染症研究基盤創生事業	HTLV-1 感染症のエピゲノムコードの解読と戦略的創薬を目指した基礎•臨床融合データサイエンス	JP23wm0325056
日本医療研究開発機構（AMED）新興・再興感染症研究基盤創生事業	レトロウイルス病原性と持続感染の根源となる不均一な潜伏集団を生み出す宿主エピゲノム特性の解明と治療薬開発	JP22wm0325017
日本医療研究開発機構（AMED）革新的がん医療実用化研究事業	シングルセルゲノミクスを用いたNOTCH1変異クローンの特性解明及び新規治療法と層別化アルゴリズムの開発	JP22ck0106703
日本医療研究開発機構（AMED）革新的がん医療実用化研究事業	アグレッシブ成人T細胞白血病リンパ腫を対象とした全国一元化レジストリ・バイオレポジトリ研究	JP23ck0106860
科学研究費助成事業基盤研究（C）	ゲノム異常とエピゲノム異常によるATLの協奏的クローン進化メカニズムの解明	JP21K08386

関連論文

タイトル	DOI	データセット ID
Chronological genome and single-cell transcriptome integration characterizes the evolutionary process of adult T cell leukemia-lymphoma	https://doi.org/10.1038/s41467-021-25101-9 (新しいタブで開きます)	JGAD000412
Mechanisms of action and resistance in histone methylation-targeted therapy	https://doi.org/10.1038/s41586-024-07103-x (新しいタブで開きます)	JGAD000674

制限公開データの利用者一覧

研究代表者	所属機関	国・州名	研究題目	データ利用期間	データセット ID
松岡雅雄	血液・膠原病・感染症内科学講座, 熊本大学大学院生命科学研究部	日本	悪性リンパ腫、成人T細胞白血病・リンパ腫の遺伝・病理学的検討を用いた特性および経過・治療に関する後方視的観察研究	2022-05-18 – 2030-03-31	JGAD000412
浜田道昭	浜田研究室, 理工学術院, 早稲田大学	日本	RNA標的創薬データベースの構築	2023-01-05 – 2027-10-31	JGAD000412 JGAD000674
Tomohiro Aoki	Division of Medical Oncology & Hematology, Princess Margaret Cancer Centre	カナダ (オンタリオ州)	Tumor-microenvironment ecosystem in ALCL	2025-05-07 – 2030-02-28	JGAD000412 JGAD000674