研究 ID
hum0236-v1リリース情報
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研究題目
肺がんの複雑な遺伝子変異を利用した腫瘍浸潤リンパ球療法の開発を目指した基礎的検討
研究概要
- 目的
- 非小細胞肺がんにおける異常スプライシングアイソフォームとネオ抗原候補の同定
- 研究方法
- ロングリードシークエンサー（MinION）により、がんに発現する転写産物の全長を同定した。また、ショートリードシークエンサーによるRNA sequence、whole exome sequenceデータと組み合わせ、異常転写産物から生じるネオ抗原候補を同定した。
- 対象
- 非小細胞肺癌臨床検体（7例、非腫瘍組織と腫瘍組織のペア）
データセット
| カート | データセット ID | データの種類 | 解析手法 | アクセス制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|---|---|
| JGAD000345 | NGS（Exome） NGS（RNA-seq [MinION]） NGS（RNA-seq [HiSeq 2500]） |
| 制限公開（Type I） | 2020-12-10 |
提供者
- 研究代表者
- 中面 哲也
- 所属機関
- 国立がん研究センター 先端医療開発センター 免疫療法開発分野
研究プロジェクト情報
研究プロジェクト情報はありません。
助成金情報
| 科研費・助成金名 | 研究課題名 | 研究課題番号 |
|---|---|---|
科学研究費助成事業 新学術領域研究 | 先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム |
|
科学研究費助成事業 若手研究 | ナノポアシークエンサーを用いたRNA合成及び分解の新規解析手法の開発 |
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科学研究費助成事業 若手研究 | 長鎖シークエンサーによる全長RNA解読が可能にするがんの新規ネオ抗原評価法の開発 |
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関連論文
関連論文はありません。
制限公開データの利用者一覧
| 研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | データ利用期間 | データセット ID |
|---|---|---|---|---|---|
| Youping Deng | Department of Complementary & Integrative Medicine, University of Hawaii Manoa | アメリカ合衆国 (ハワイ州) | Identification of driver genes and somatic mutations for lung cancer diagnosis and prognosis | 2018-10-04 – 2029-07-10 | |
| 河野 隆志 | ゲノム生物学研究分野, 国立研究開発法人国立がん研究センター研究所 | 日本 | AYA(Adolescence and Young Adult)世代がんの個別化予防に資する遺伝要因の同定を目指す研究 | 2021-12-02 – 2028-12-31 | |
| 中岡 博史 | 腫瘍ゲノム研究部, 公益財団法人佐々木研究所 | 日本 | 肺がん遺伝子解析研究 | 2022-08-17 – 2026-07-23 | |
| 浜田 道昭 | 浜田研究室, 理工学術院, 早稲田大学 | 日本 | RNA標的創薬データベースの構築 | 2023-01-05 – 2027-10-31 |