2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします
現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです
NBDC ヒトデータベース申請業務ならびにJGA関係の業務につきまして、以下の期間休業いたします：2026年8月12日(水) 〜 2026年8月17日(月) 休業期間中にいただいた申請やお問い合わせ等は、休業明けの 8月18日(火) より順次対応させていただきます。 上記休業期間の前後は通常より対応が遅れることがあります。予めご了承ください。 ご迷惑をおかけいたしますが、ご理解とご協力をお願いいたします。
目的: ヒトT細胞白血病ウイルス (HTLV-1) 関連脊髄症 (HAM) の遺伝子変異解析を通じて成人T細胞白血病の発症リスクを推定する
研究方法: 次世代シークエンサーを用いたTarget capture sequencing、RNA sequencing、ATAC sequencing、single-cell Multiome (scRNA-seq、scATAC-seq)
対象: 【Target capture sequencing】HAM21症例の感染細胞分画 (腫瘍細胞) 及び非感染細胞分画 (非腫瘍細胞) 【RNA-seq】HAM13症例の末梢血由来単核球より分離した感染細胞 【ATAC-seq】HAM2症例の末梢血由来単核球より分離した感染細胞 【single-cell Multiome】HAM2症例の末梢血由来単核球と腫瘍細胞および無症候性HTLV-1感染3症例の末梢血由来単核球
データセット ID | アクセス制限 | データの種類 | 公開日 | |
|---|---|---|---|---|
| JGAD000318 | 制限公開（Type I） | NGS(Target Capture) | 2020-09-28 | |
| JGAD000977 | 制限公開（Type I） | NGS(RNA-seq、ATAC-seq、scMultiome) | 2025-09-24 | |
研究プロジェクト名 | URL |
|---|---|
| 感染症ゲノム腫瘍学分野 / 病因病態解析部門 | https://square.umin.ac.jp/yamagishi/ |
科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
|---|---|---|
| 日本医療研究開発機構 (AMED) 新興・再興感染症に対する革新的医薬品等開発推進研究事業 | HTLV-1関連疾患の発症リスク、進展メカニズムに関するオミックス統合解析と発症予防に資する基盤的研究 |
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| 科学研究費助成事業 基盤研究 (B) | HAMのHTLV-1感染細胞の異常形質を規定するゲノム・エピゲノム制御機構の解析 |
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| 日本医療研究開発機構 (AMED) 難治性疾患実用化研究事業 | HAM・HTLV-1陽性難治性疾患の診療ガイドラインに資する統合的レジストリの構築によるエビデンスの創出 |
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| 日本医療研究開発機構 (AMED) 新興・再興感染症に対する革新的医薬品等開発推進研究事業 | ゲノム情報を基盤としたHTLV-1感染症の病態形成機序の解明及び発症リスク予知アルゴリズム開発に関する総合的研究 |
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タイトル | DOI | データセット |
|---|---|---|
| Mortality and risk of progression to adult T-cell leukemia/lymphoma in patients with HTLV-1-associated myelopathy/tropical spastic paraparesis | https://doi.org/10.1073/pnas.1920346117 | |
名前 | 所属機関 | 国 | 研究題目 | データ利用期間 | データセット一覧 |
|---|---|---|---|---|---|
| 浜田道昭 | Waseda University | Japan | RNA標的創薬データベースの構築 | 2023-01-05—2027-10-31 | |
| 安永純一朗 | Kumamoto University | Japan | 悪性リンパ腫、成人T細胞白血病・リンパ腫の遺伝・病理学的検討を用いた特性および経過・治療に関する後方視的観察研究 | 2022-05-18—2030-03-31 | |
| 松岡雅雄 | Kumamoto University | Japan | 悪性リンパ腫、成人T細胞白血病・リンパ腫の遺伝・病理学的検討を用いた特性および経過・治療に関する後方視的観察研究 | 2022-05-18—2030-03-31 | |