研究題目
消化器癌のゲノム・遺伝子解析とその臨床病理学的意義の解明
研究概要
目的: 肝細胞がんゲノムへのウイルスゲノム挿入部位解析
研究方法: ウイルスキャプチャーシーケンス (NGS) 、Exome (NGS) 、RNA-seq (NGS) 、DNA_methylation (Infinium450K)
対象: 肝細胞がん 243＋160症例
2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします
現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです
NBDC Research ID:hum0187-v2
リリース情報 データセット一覧
データセット ID | アクセス制限 | データの種類 | 公開日 | |
|---|---|---|---|---|
| JGAD000277 | 制限公開（Type I） | NGS(Target Capture) | 2020-09-28 | |
| JGAD000328 | 制限公開（Type I） | NGS(Exome、RNA-seq)、Methylation array | 2021-06-04 | |
| JGAD000329 | 制限公開（Type I） | NGS(Exome、RNA-seq)、Methylation array | 2021-06-04 | |
| JGAD000330 | 制限公開（Type I） | NGS(Exome、RNA-seq)、Methylation array | 2021-06-04 | |
提供者情報
- 研究代表者
- 油谷 浩幸
- 所属機関名
- 東京大学先端科学技術研究センター
研究プロジェクト情報
研究プロジェクト名 | URL |
|---|---|
| ゲノムサイエンス分野 | https://www.genome.rcast.u-tokyo.ac.jp/ja/research |
助成金情報
科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
|---|---|---|
| 日本医療研究開発機構 (AMED) 医療機器開発推進研究事業 | 肝臓癌の術後生存率を高め、医療費低減を可能とする人工知能・質量分析診断支援装置の治験 |
|
| 日本医療研究開発機構 (AMED) 革新的がん医療実用化研究事業 | 国際共同研究に資する日本人難治性がん・生活習慣病関連がん大規模統合ゲノミクス解析と国際コンソーシアムでのデータ共有による国際貢献 |
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| 日本医療研究開発機構 (AMED) 肝炎等克服緊急対策研究事業 | ウイルス性肝疾患を含む代謝関連肝がん発生の病態解明に関する研究 |
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| 科学研究費助成事業 基盤研究 (C) | がんゲノム解析で残された微小コピー数変化の検出とその意義の解明 |
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関連論文
タイトル | DOI | 利用データID |
|---|---|---|
| Impact of AAV2 and Hepatitis B Virus Integration Into Genome on Development of Hepatocellular Carcinoma in Patients with Prior Hepatitis B Virus Infection | https://doi.org/10.1158/1078-0432.CCR-18-4041 | |
| Accumulation of Molecular Aberrations Distinctive to Hepatocellular Carcinoma Progression | https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-20-0225 | |
制限公開データの利用者一覧
研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | データ利用期間 | 利用データID |
|---|---|---|---|---|---|
| 浜田道昭 | Waseda University | Japan | RNA標的創薬データベースの構築 | 2023-01-05—2027-10-31 | |
| Huang Jinyan | Zhejiang University | China | Comprehensive analysis of alternative splicing in malignant tumors | 2022-03-15—2024-01-02 | |
| Cao Jian | Rutgers, The State University of New Jersey | USA | Analyzing oncovirus in NBDC tumor sequencing data | 2023-01-12—2026-03-12 | |
| 河野隆志 | National Cancer Center Research Institute | Japan | AYA(Adolescence and Young Adult)世代がんの個別化予防に資する遺伝要因の同定を目指す研究 | 2021-12-02—2028-12-31 | |