研究 ID
hum0179-v1リリース情報
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研究題目
薬剤関連顎骨壊死における口腔内微生物叢メタゲノム解析
研究概要
- 目的
- ロングリードデータにより、口腔内細菌叢・ファージ叢に関する理解がどれだけ深まるかを検討する
- 研究方法
- 保存キット（OMNIgeneORAL OM-501）で保存された唾液から酵素法にて抽出したbulk DNAを用いたPromethION（1フローセルにつき1サンプル）によるショットガンメタゲノム解読
- 対象
- 日本人集団の唾液
- URL
- N/A
データセット
| カート | データセット ID | データの種類 | 解析手法 | アクセス制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|---|---|
| JGAD000268 | メタゲノム |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| DRA009794 | メタゲノム（ヒト配列除去済み） |
| 非制限公開 | 2020-03-16 |
提供者
- 研究代表者
- 矢原 耕史
- 所属機関
- 国立感染症研究所・薬剤耐性研究センター
研究プロジェクト情報
| 研究プロジェクト名 | URL |
|---|---|
新学術領域「ネオウイルス学」 |
助成金情報
| 科研費・助成金名 | 研究課題名 | 研究課題番号 |
|---|---|---|
科学研究費助成事業 新学術領域研究 | 拡張viromeデータと長鎖シーケンサーを用いたファージと宿主のビッグデータ解析 |
|
関連論文
| タイトル | DOI | データセット ID |
|---|---|---|
Long-read metagenomics using PromethION uncovers novel oral bacteriophages, their abundance, and interaction with host bacteria |
制限公開データの利用者一覧
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