データセット ID
JGAD000268
- データの種類
- メタゲノム
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 255 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- TXT
- 研究
- hum0179
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-11-18
- DDBJ Search
- JGAD000268 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000186 (新しいタブで開きます)
解析手法
Metagenomics
- 材料と対象者
- 健常者：4名
- 健康状態健常
- 対象者数4 (人数)
- 試料説明
- 唾液より抽出したDNA
- 組織唾液
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Metagenomics
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Ligation Sequencing Kit (SQK-LSK109)
Nextera XT DNA Library Prep Kit - 断片化
- N/A
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq
Oxford Nanopore Technologies PromethION - リードタイプ
- 混在
- リード長
- 13 kbp (1．可変, 平均)
300 bp (2．) - 解析方法
- EDGE pipeline