本文へ
NBDC ヒトデータベース

カートに入れたデータセットはありません。

カートを見る

現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

研究 ID

hum0158-v1リリース情報

このページは過去のバージョン (v1) です。最新のバージョンは v3 です。
最新バージョン (v3)

研究題目

シークエンス解析によるがんゲノム研究：肝臓がん

研究概要

目的
日本人の肝臓がんにおけるゲノム変異を探索する
研究方法
肝臓がん切除切片における腫瘍組織および非腫瘍組織または末梢血より抽出したDNAもしくはRNAを使用したNGSライブラリーを作成後、Illumina HiSeqまたは Genome Analyzerにて塩基配列を決定する。
対象
肝臓がん（肝細胞がん、肝内胆管がん、混合型肝がん）患者の非腫瘍組織および腫瘍組織のDNA・RNA
URL
N/A

データセット

データセットの一覧はこのバージョンのものですが、各データセットの内容は現在のものを表示しています。

カートデータセット IDデータの種類解析手法アクセス制限公開日
JGAD000228NGS（WGS）
NGS（RNA-seq）
  • WGS
制限公開（Type I）2020-09-28
JGAD000229NGS（WGS）
NGS（RNA-seq）
  • RNA-seq
制限公開（Type I）2020-09-28

提供者

研究代表者
中川 英刀
所属機関
理化学研究所 生命医科学研究センター

研究プロジェクト情報

研究プロジェクト情報はありません。

助成金情報

助成金情報はありません。

関連論文

タイトルDOIデータセット ID
Whole-genome mutational landscape and characterization of noncoding and structural mutations in liver cancer.
https://doi.org/10.1038/ng.3547 (新しいタブで開きます)
Genomic and Transcriptomic Profiling of Combined Hepatocellular and Intrahepatic Cholangiocarcinoma Reveals Distinct Molecular Subtypes.
https://doi.org/10.1016/j.ccell.2019.04.007 (新しいタブで開きます)

制限公開データの利用者一覧

研究代表者所属機関国・州名研究題目データ利用期間データセット ID
山本 雅之東北メディカル・メガバンク機構, 東北大学日本日本人全ゲノムデータベースの構築2019-06-24 – 2022-04-15
寶珍 輝尚情報工学・人間科学系, 京都工芸繊維大学日本機械学習によるヒトゲノム変異の解析2019-07-09 – 2022-03-23
白石 航也ゲノム生物学研究分野, 国立研究開発法人国立がん研究センター研究所日本ゲノム解析に基づく宿主並びに腫瘍における免疫応答ネットワーク機構の解明2019-08-05 – 2029-03-31
小笠原 理生命情報・DDBJセンター, 国立遺伝学研究所日本JGA/AGD ゲノムデータを利用したヒトゲノム解析ワークフローの評価2019-10-11 – 2024-07-05
Robert TsaiInstitute of Biosciences & Technology, Texas A&M Health Science Centerアメリカ合衆国 (テキサス州)Genome-wide Discovery of new Plasma DNA Methylation Markers for Tracking the Progression of NAFLD to NASH and HCC2020-11-09 – 2023-07-25
Kichoon Leeアメリカ合衆国Access to the National Bioscience Database Center2021-05-31 – 2024-12-31
Jinyan HuangZhejiang University School of Medicine, 79 Qingchun Road, Hangzhou, 310003, Zhejiang, China. Biomedical big data center, the First Affiliated Hospital, Zhejiang University中国Comprehensive analysis of alternative splicing in malignant tumors2022-03-15 – 2024-01-01
浜田 道昭浜田研究室, 理工学術院, 早稲田大学日本RNA標的創薬データベースの構築2023-01-05 – 2027-10-31