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NBDC ヒトデータベース
JGAD000229
公開日
2020-09-28

更新日
2020-09-28

研究
hum0158

データの種類
NGS(WGS) NGS(RNA-seq)

アクセス制限
制限公開(Type I)

JGA Study
JGAS000151

解析手法

RNA-seq

材料と対象者

肝臓がん: 238 症例 (肝細胞がん [ICD10: C220]、肝内胆管がん [ICD10: C221]、混合型肝がん [ICD10: C227]) 腫瘍組織: 238 検体 非腫瘍組織: 201 検体

実験方法

RNA-seq

プラットフォーム

Illumina [HiSeq 2000, Genome Analyzer IIx]

試料説明

肝臓がん切除切片における腫瘍組織および非腫瘍組織から抽出したRNA

ライブラリ構築

TruSeq RNA Sample Prep Kit v2 もしくは TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit

断片化

熱処理

リードタイプ

Paired-end

リード長

100 bp

JGAデータセットAccession
総データ量

3 TB(fastq)

利用ポリシー