データセット ID
JGAD000229
- データの種類
- NGS（WGS）
NGS（RNA-seq） - アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 2.8 TB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0158
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-09-28
- DDBJ Search
- JGAD000229 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000151 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA-seq
- 材料と対象者
- 肝臓がん：238 症例
（肝細胞がん [ICD10：C220]、肝内胆管がん [ICD10：C221]、混合型肝がん [ICD10：C227]）
腫瘍組織：238 検体
非腫瘍組織：201 検体 - 健康状態罹患
- 対象者数238 (人数)
- 疾患
- 肝細胞がん
- 肝内胆管がん
- 混合型肝がん
- 試料説明
- 肝臓がん切除切片における腫瘍組織および非腫瘍組織から抽出したRNA
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- TruSeq RNA Library Prep Kit
TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit - 断片化
- 熱処理
- プラットフォーム
- Illumina Genome Analyzer IIx
Illumina HiSeq 2000 - リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 100 bp