HumanDBs

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

NBDC Research ID:hum0157-v1

リリース情報

研究題目

がんのクリニカルシークエンスと付随研究としての網羅的ゲノム・エピゲノム解析

研究概要

目的: がんのクリニカルシークエンスおよび付随研究としての網羅的ゲノム・エピゲノム解析

研究方法: 腫瘍FFPE検体から抽出したDNA、RNA、および対照コントロールとして同一症例の正常血液から抽出したDNAをNextSeq (Illumina) を用いて配列決定した

対象: 183症例のがん (肺がん53例、肉腫39例、大腸がん24例、子宮がん15例、卵巣がん12例、子宮肉腫8例、下咽頭癌4例、腺様嚢胞がん4例、原発不明がん5例、その他組織型のがん19例)

データセット一覧

	データセット ID	アクセス制限	データの種類	公開日
	JGAD000242	制限公開（Type I）	NGS(Target Capture)	2020-09-28

提供者情報

研究代表者: 宮園浩平
所属機関名: 東京大学大学院医学系研究科分子病理学分野

研究プロジェクト情報

研究プロジェクト名	URL
データなし

助成金情報

科研費・助成金名	タイトル	研究課題番号
日本医療研究開発機構 (AMED) 臨床ゲノム情報統合データベース整備事業	大規模ゲノム医療体制の確立と知識データベースの構築	JP18kk0205003
日本医療研究開発機構革新的先端研究開発支援事業インキュベートタイプ (AMED-LEAP)	がん治療標的探索プロジェクト	JP18am0001001
日本医療研究開発機構 (AMED) 革新的がん医療実用化研究事業	革新的がん遺伝子機能解析法によるプレシジョンメディシンの実現	JP18ck0106252
日本医療研究開発機構 (AMED) 次世代がん医療創生研究事業 (P-CREATE)	ヒト上皮性腫瘍の発生・進展機構の解明と新規治療標的の同定	JP18cm0106502

タイトル	DOI	利用データID
Comprehensive assay for the molecular profiling of cancer by target enrichment from formalin-fixed paraffin-embedded specimens.	https://doi.org/10.1111/cas.13968	JGAD000242
MicroSEC filters sequence errors for formalin-fixed and paraffin-embedded samples	https://doi.org/10.1038/s42003-021-02930-4	JGAD000242

制限公開データの利用者一覧

研究代表者	所属機関	国・州名	研究題目	データ利用期間	利用データID
中岡博史	Kagoshima University Graduate School of Medical and Dental Sciences	Japan	大規模シーケンスデータを用いた乳がん関連遺伝子における活性低下型変異の研究	2022-08-17—2026-07-23	JGAD000242