研究 ID
hum0157-v1リリース情報
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研究題目
がんのクリニカルシークエンスと付随研究としての網羅的ゲノム・エピゲノム解析
研究概要
- 目的
- がんのクリニカルシークエンスおよび付随研究としての網羅的ゲノム・エピゲノム解析
- 研究方法
- 腫瘍FFPE検体から抽出したDNA、RNA、および対照コントロールとして同一症例の正常血液から抽出したDNAをNextSeq（Illumina）を用いて配列決定した
- 対象
- 183症例のがん（肺がん53例、肉腫39例、大腸がん24例、子宮がん15例、卵巣がん12例、子宮肉腫8例、下咽頭癌4例、腺様嚢胞がん4例、原発不明がん5例、その他組織型のがん19例）
- URL
- N/A
データセット
| カート | データセット ID | データの種類 | 解析手法 | アクセス制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|---|---|
| JGAD000242 | NGS（Target Capture） |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 |
提供者
- 研究代表者
- 宮園 浩平
- 所属機関
- 東京大学大学院医学系研究科 分子病理学分野
研究プロジェクト情報
研究プロジェクト情報はありません。
助成金情報
| 科研費・助成金名 | 研究課題名 | 研究課題番号 |
|---|---|---|
日本医療研究開発機構（AMED） 臨床ゲノム情報統合データベース整備事業 | 大規模ゲノム医療体制の確立と知識データベースの構築 |
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日本医療研究開発機構 革新的先端研究開発支援事業インキュベートタイプ（AMED-LEAP） | がん治療標的探索プロジェクト |
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日本医療研究開発機構（AMED） 革新的がん医療実用化研究事業 | 革新的がん遺伝子機能解析法によるプレシジョンメディシンの実現 |
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日本医療研究開発機構（AMED） 次世代がん医療創生研究事業（P-CREATE） | ヒト上皮性腫瘍の発生・進展機構の解明と新規治療標的の同定 |
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関連論文
| タイトル | DOI | データセット ID |
|---|---|---|
Comprehensive assay for the molecular profiling of cancer by target enrichment from formalin-fixed paraffin-embedded specimens. | ||
MicroSEC filters sequence errors for formalin-fixed and paraffin-embedded samples |
制限公開データの利用者一覧
| 研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | データ利用期間 | データセット ID |
|---|---|---|---|---|---|
| 中岡 博史 | 腫瘍ゲノム研究部, 公益財団法人佐々木研究所 | 日本 | 肺がん遺伝子解析研究 | 2022-08-17 – 2026-07-23 |