システムメンテナンスに伴い、以下の日程で、NBDCヒトデータベース申請システムならびにヒトデータ審査委員会による審査が停止いたします。
停止期間：2026年10月5日(月) 9:00 ～ 10月7日(水) 15:00
ご迷惑をおかけしますが、どうぞ宜しくお願いいたします。

現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

研究 ID

hum0103-v3リリース情報

このページは過去のバージョン (v3) です。最新のバージョンは v4 です。

最新バージョン (v4)

研究題目

シークエンス解析によるがんゲノム研究：胆道がん

研究概要

目的: 日本人の胆道がんにおけるゲノム変異を探索する
研究方法: 胆道がん切除切片における非腫瘍組織（正常組織）および腫瘍組織より抽出したDNA/RNAを使用したNGSライブラリーを作成後、Illumina HiSeq 2000/2500、NovaSeq 6000にて塩基配列を決定する。
対象: 胆道がん症例の腫瘍組織および非腫瘍組織のDNA/RNA、ならびに正常胆嚢の非腫瘍組織のRNA
URL: N/A

データセット

データセットの一覧はこのバージョンのものですが、各データセットの内容は現在のものを表示しています。

カート	データセット ID	データの種類	解析手法	アクセス制限	公開日
	JGAD000117	NGS（WGS） NGS（Exome）	WGS	制限公開（Type I）	2020-09-28
	JGAD000403	NGS（WGS）のbam/gvcfデータ	WGS	制限公開（Type I）	2021-05-25
	JGAD000118	NGS（WGS） NGS（Exome）	WES	制限公開（Type I）	2020-09-28

提供者

研究代表者: 中川英刀
所属機関: 理化学研究所生命医科学研究センター

研究プロジェクト情報

研究プロジェクト情報はありません。

助成金情報

科研費・助成金名	研究課題名	研究課題番号
科学研究費助成事業基盤研究（A）	肝胆膵がんの多元的オミックス解析による分子機構の解明	18H04049
日本医療研究開発機構（AMED）次世代がん医療創生研究事業（P-CREATE）	がんゲノム解析による新規免疫療法および複合免疫療法開発のためのシーズ探索	JP20cm0106552

関連論文

タイトル	DOI	データセット ID
Genomic characterization of biliary tract cancers identifies driver genes and predisposing mutations	https://doi.org/10.1016/j.jhep.2018.01.009 (新しいタブで開きます)	JGAD000117 JGAD000118
Molecular Classification and Tumor Microenvironment Characterization of Gallbladder Cancer by Comprehensive Genomic and Transcriptomic Analysis	https://doi.org/10.3390/cancers13040733 (新しいタブで開きます)	JGAD000504 JGAD000505 JGAD000506
Actionability evaluation of biliary tract cancer by genome transcriptome analysis and Asian cancer knowledgebase	https://doi.org/10.18632/oncotarget.28021 (新しいタブで開きます)	JGAD000504 JGAD000505 JGAD000506

制限公開データの利用者一覧

研究代表者	所属機関	国・州名	研究題目	データ利用期間	データセット ID
柴田龍弘	がんゲノミクス研究分野, 国立がん研究センター研究所	日本	ゲノム異常解析に基づく､肝がん､膵がん､肺がん､胃がん､大腸がん､胆道がん､乳がん､食道がん､卵巣がん､子宮がん､膀胱がん､頭頸部がん､骨軟部肉腫の発生･進展の分子機構の解明	2018-09-11 – 2018-11-28	JGAD000117 JGAD000118
山本雅之	東北メディカル・メガバンク機構, 東北大学	日本	日本人全ゲノムデータベースの構築	2019-06-24 – 2022-04-15	JGAD000117
Justo Lorenzo Bermejo	Statistical Genetics Research Group. Institute of Medical Biometry, Heidelberg University Hospital	ドイツ	Genomic characterization of gallbladder tumors from patients worldwide	2022-10-13 – 2028-12-31	JGAD000118 JGAD000505
山本拓也	プレシジョン免疫プロジェクト, 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所	日本	新規がん抗原の同定に基づく消化器がんおよび悪性黒色腫（メラノーマ）に対するワクチン開発基盤研究	2024-11-12 – 2026-03-31	JGAD000117 JGAD000118 JGAD000504