データセット ID
JGAD000505
- データの種類
- NGS（WGS）
NGS（Exome）
NGS（RNA-seq） - アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 626 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0103
- 公開日
- 2022-01-14
- 更新日
- 2022-01-14
- DDBJ Search
- JGAD000505 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000389 (新しいタブで開きます)
解析手法
WES
- 材料と対象者
- 胆道がん（ICD10：C221, C240, C248, C23）：29 症例（3症例はWGSに含まれる）
腫瘍組織：29 検体
非腫瘍組織：29 検体 - 健康状態罹患
- 対象者数110 (人数)
- 疾患
- 胆道がん
- 胆道がん
- 試料説明
- 胆道がん切除切片における腫瘍組織および非腫瘍組織から抽出したDNA
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Nextera Rapid Capture Kit
SureSelect Human All Exon V5 - 断片化
- 超音波断片化（Covaris）
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2000
Illumina HiSeq 2500 - リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 93 bp
126 bp