研究 ID

hum0082-v2リリース情報

Name: 日本人健常者におけるゲノム全域のSNP解析
Published: 2017-10-03

研究題目

日本人健常者におけるゲノム全域のSNP解析

目的: 日本人健常者におけるゲノム全域のSNPを解析
研究方法: （1）Affymetrix Genome-Wide Human SNP Array 6.0を使用して約90万個の変異のGenotypeを決定
（2）Affymetrix Axiom ASI 1 Arrayを使用して約60万個の変異のGenotypeを決定
対象: 日本人健常者419名
URL: N/A

データセット ID	データの種類	解析手法	アクセス制限	公開日
JGAD000130	Affymetrix Genome-Wide Human SNP Array 6.0により決定した日本人健常者418名のGentoypeデータ	Genotyping by array	制限公開（Type I）	2020-09-28
NHA000057	Affymetrix Genome-Wide Human SNP Array 6.0により決定した日本人健常者418名のGentoypeカウント情報	Genotyping by array	非制限公開	2017-09-26
JGAD000131	Affymetrix Axiom Genome-Wide ASI 1 Arrayにより決定した日本人健常者419名のGenotypeデータ	Genotyping by array	制限公開（Type I）	2020-09-28
NHA000058	Affymetrix Axiom Genome-Wide ASI 1 Arrayにより決定した日本人健常者419名のGenotypeカウント情報	Genotyping by array	非制限公開	2017-09-26

研究プロジェクト情報はありません。

科研費・助成金名	研究課題名	研究課題番号
科学研究費助成事業新学術領域研究	ゲノム科学の総合的推進に向けた大規模ゲノム情報生産・高度情報解析支援	221S0002
科学研究費助成事業新学術領域研究	先端技術を駆使したHLA多型・進化・疾病に関する統合的研究	22133008

タイトル	DOI	データセット ID
A polymorphism in CCR1/CCR3 is associated with narcolepsy	https://doi.org/10.1016/j.bbi.2015.05.003 (新しいタブで開きます)	NHA000057 JGAD000130
Genome-wide association study of HLA-DQB1*06:02 negative essential hypersomnia	https://doi.org/10.7717/peerj.66 (新しいタブで開きます)	NHA000057 JGAD000130
Genome-wide association study identifies TNFSF15 and POU2AF1 as susceptibility loci for primary biliary cirrhosis in the Japanese population	https://doi.org/10.1016/j.ajhg.2012.08.010 (新しいタブで開きます)	NHA000058 JGAD000131
IKZF1, a new susceptibility gene for cold medicine-related Stevens-Johnson syndrome/toxic epidermal necrolysis with severe mucosal involvement	https://doi.org/10.1016/j.jaci.2014.12.1916 (新しいタブで開きます)	NHA000058 JGAD000131

研究代表者	所属機関	国・州名	研究題目	データ利用期間	データセット ID
宮川卓	睡眠プロジェクト, 東京都医学総合研究所	日本	過眠を呈する睡眠障害（各種過眠症・概日リズム睡眠障害・睡眠時無呼吸症候群・睡眠関連運動障害・睡眠時随伴症など）の病態に関与する遺伝子の探索とその機能及び末梢血リンパ球の自己抗原特異的増殖反応の研究	2023-07-21 – 2027-03-31	JGAD000131