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NBDC ヒトデータベース

カートに入れたデータセットはありません。

システムメンテナンスに伴い、以下の日程で、NBDCヒトデータベース申請システムならびにヒトデータ審査委員会による審査が停止いたします。
停止期間:2026年10月5日(月) 9:00 ~ 10月7日(水) 15:00
ご迷惑をおかけしますが、どうぞ宜しくお願いいたします。

現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所(NIG)バイオデータ研究拠点(BSI)ライフサイエンス統合データベース部門(DBCLS)」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

データセット ID

JGAD000131

データの種類
Affymetrix Axiom Genome-Wide ASI 1 Arrayにより決定した日本人健常者419名のGenotypeデータ
アクセス制限
制限公開(Type I)
総データ量
21.0 GB
ファイル形式
  • CEL
  • CHP
研究
hum0082
公開日
2020-09-28
更新日
2020-11-18

解析手法

Genotyping by array

材料と対象者
日本人健常者 :419名
  • 健康状態
    健常
  • 対象者数
    419 (人数)
  • 対象集団
    日本人
試料説明
末梢血から抽出したgDNA
  • 組織
    末梢血
  • 腫瘍 / 非腫瘍
    非腫瘍
試料の入手元
N/A
実験方法
Genotyping by array
測定対象
N/A
試薬キット
Axiom 2.0 Reagent Kit
プラットフォーム
Affymetrix Axiom Genome-Wide ASI 1 Array
参照ゲノム
GRCh37
QC・フィルタリング
overall call rate < 0.97、SNP call rate < 0.95、HWE P < 0.001、MAF < 0.01
解析方法
Genotyping Console v4.1
バリアント数
490,744 SNPs