2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします
現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです
NBDC ヒトデータベース申請業務ならびにJGA関係の業務につきまして、以下の期間休業いたします：2026年8月12日(水) 〜 2026年8月17日(月) 休業期間中にいただいた申請やお問い合わせ等は、休業明けの 8月18日(火) より順次対応させていただきます。 上記休業期間の前後は通常より対応が遅れることがあります。予めご了承ください。 ご迷惑をおかけいたしますが、ご理解とご協力をお願いいたします。
目的: ゲノムワイドなエピゲノム解析 (mRNA発現定量) を用いた検討により、非アルコール性脂肪肝性疾患 (non-alcoholic fatty liver disease: NAFLD) の発症や進展に関連した遺伝子を同定し、その病態を明らかにする。
研究方法: 肝臓組織から抽出したmRNAを対象としたRNA-seq解析、および、肝臓組織から抽出したDNAを対象としたメチル化アレイ解析
対象: NAFLD患者由来の肝臓組織56検体についてはRNAシークエンスとメチル化解析の両方、4検体はRNAシークエンスのみ、4検体はDNAメチル化解析のみ、 (計64検体)
データセット ID | アクセス制限 | データの種類 | 公開日 | |
|---|---|---|---|---|
| JGAD000059 | 制限公開（Type I） | NGS(RNA-seq) メチル化アレイ | 2020-09-28 | |
研究プロジェクト名 | URL |
|---|---|
| データなし | |
科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
|---|---|---|
| 科学研究費助成事業 基盤研究 (C) | 異所性脂肪蓄積の遺伝素因と環境因子の検索と前向き追跡調査での検証 |
|
| 科学研究費助成事業 基盤研究 (C) | 非アルコール性脂肪肝疾患のゲノム・エピゲノム解析による病態解明と診断方法の開発 |
|
| 科学研究費助成事業 基盤研究 (C) | 非アルコール性脂肪肝障害の発症・進行に関連する遺伝素因と環境因子の解析 |
|
タイトル | DOI | データセット |
|---|---|---|
| Identification of core gene networks and hub genes associated with progression of nonalcoholic fatty liver disease by RNA sequencing | https://doi.org/10.1111/hepr.12877 | |
| Identification of the genomic region under epigenetic regulation during nonalcoholic fatty liver disease progression. | https://doi.org/10.1111/hepr.12992 | |
名前 | 所属機関 | 国 | 研究題目 | データ利用期間 | データセット一覧 |
|---|---|---|---|---|---|
| 浜田道昭 | Waseda University | Japan | RNA標的創薬データベースの構築 | 2023-01-05—2027-10-31 | |
| 堀田紀久子 | Osaka Ohtani University | Japan | データベースを用いた肝臓疾患（非アルコール性脂肪肝疾患、ウイルス性肝炎、アルコール性肝炎、肝硬変、肝臓癌）のゲノム・エピゲノム解析 | 2021-11-11—2023-04-05 | |
| 野島正寛 | The University of Tokyo | Japan | 非アルコール性脂肪性肝疾患における発癌リスク予測モデル開発を目標としたゲノム網羅的DNAメチル化解析 | 2019-01-21—2022-03-28 | |
| Giraudi Pablo | Fondazione Italiana Fegato (ONLUS) | Italy | Meta-analysis of omics data on non-alcoholic fatty liver disease. Implications for the improvement of an in silico strategy for biomarkers discovery on liver fibrosis | 2018-12-18—2021-02-08 | |
| Tsai Robert | Texas A&M Health Science Center | USA | Genome-wide Discovery of new Plasma DNA Methylation Markers for Tracking the Progression of NAFLD to NASH and HCC | 2020-11-09—2023-07-25 | |