研究 ID

hum0055-v1リリース情報

Name: 非アルコール性脂肪肝疾患のゲノム・エピゲノム解析
Published: 2017-02-20

研究題目

非アルコール性脂肪肝疾患のゲノム・エピゲノム解析

目的: ゲノムワイドなエピゲノム解析（mRNA発現定量）を用いた検討により、非アルコール性脂肪肝性疾患（non-alcoholic fatty liver disease：NAFLD）の発症や進展に関連した遺伝子を同定し、その病態を明らかにする。
研究方法: 肝臓組織から抽出したmRNAを対象としたRNA-seq解析、および、肝臓組織から抽出したDNAを対象としたメチル化アレイ解析
対象: NAFLD患者由来の肝臓組織56検体についてはRNAシークエンスとメチル化解析の両方、4検体はRNAシークエンスのみ、4検体はDNAメチル化解析のみ、（計64検体）
URL: N/A

カート	データセット ID	データの種類	解析手法	アクセス制限	公開日
	JGAD000059	NGS（RNA-seq）メチル化アレイ	RNA-seq メチル化アレイ	制限公開（Type I）	2020-09-28

研究プロジェクト情報はありません。

科研費・助成金名	研究課題名	研究課題番号
科学研究費助成事業基盤研究（C）	異所性脂肪蓄積の遺伝素因と環境因子の検索と前向き追跡調査での検証	25461343
科学研究費助成事業基盤研究（C）	非アルコール性脂肪肝疾患のゲノム・エピゲノム解析による病態解明と診断方法の開発	16K09781
科学研究費助成事業基盤研究（C）	非アルコール性脂肪肝障害の発症・進行に関連する遺伝素因と環境因子の解析	26460999

研究代表者	所属機関	国・州名	研究題目	データ利用期間	データセット ID
Pablo Giraudi	Fondazione Italiana Fegato (ONLUS)	イタリア	Meta-analysis of omics data on non-alcoholic fatty liver disease. Implications for the improvement of an in silico strategy for biomarkers discovery on liver fibrosis	2018-12-18 – 2021-02-08	JGAD000059
野島正寛	医科学研究所, 東京大学	日本	非アルコール性脂肪性肝疾患における発癌リスク予測モデル開発を目標としたゲノム網羅的DNAメチル化解析	2019-01-21 – 2022-03-28	JGAD000059
Robert Tsai	Institute of Biosciences & Technology, Texas A&M Health Science Center	アメリカ合衆国 (テキサス州)	Genome-wide Discovery of new Plasma DNA Methylation Markers for Tracking the Progression of NAFLD to NASH and HCC	2020-11-09 – 2023-07-25	JGAD000059
堀田紀久子	薬学部　薬物治療学講座, 大阪大谷大学	日本	データベースを用いた肝臓疾患（非アルコール性脂肪肝疾患、ウイルス性肝炎、アルコール性肝炎、肝硬変、肝臓癌）のゲノム・エピゲノム解析	2021-11-11 – 2023-04-05	JGAD000059
浜田道昭	浜田研究室, 理工学術院, 早稲田大学	日本	RNA標的創薬データベースの構築	2023-01-05 – 2027-10-31	JGAD000059

タイトル	DOI	データセット ID
Identification of core gene networks and hub genes associated with progression of nonalcoholic fatty liver disease by RNA sequencing	https://doi.org/10.1111/hepr.12877 (新しいタブで開きます)	JGAD000059
Identification of the genomic region under epigenetic regulation during nonalcoholic fatty liver disease progression.	https://doi.org/10.1111/hepr.12992 (新しいタブで開きます)	JGAD000059