研究 ID
hum0028-v2リリース情報
最新
研究題目
オーダーメイド医療の実現プログラム
研究概要
- 目的
- HLA遺伝子型推定に用いる日本人健常者参照データの作成
- 研究方法
- 6番染色体単腕上のmajor histocompatibility comples（MHC）領域内single nucleotide polymorphisms（SNP）の遺伝子型をIllumina（HumanOmniExpress BeadChip, HumanExome BeadChip, Immunochip, HumanHap550v3 Genotyping BeadChip）を用いて決定する。さらに、HLA 7座位（HLA-A/C/B/DRB1/DQB1/DPA1/DPB1）のアリルをWAKFlow HLA typing kitにて、また、1座位（HLA-DQA1）のアリルを塩基配列情報を元に決定した。
- 対象
- 日本人健常者908名
データセット
| カート | データセット ID | データの種類 | 解析手法 | アクセス制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|---|---|
| JGAD000018 | HLA領域（7座位）の遺伝子型情報およびHLAアリル情報 |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 |
提供者
- 研究代表者
- 久保 充明
- 所属機関
- 理化学研究所 統合生命医科学研究センター
研究プロジェクト情報
| 研究プロジェクト名 | URL |
|---|---|
基盤技術開発研究チーム、統計解析研究チーム |
助成金情報
| 科研費・助成金名 | 研究課題名 | 研究課題番号 |
|---|---|---|
文部科学省 科学技術試験研究委託事業費 | オーダーメイド医療の実現プログラム（第3期） | N/A |
関連論文
| タイトル | DOI | データセット ID |
|---|---|---|
Construction of a population-specific HLA imputation reference panel and its application to Graves' disease risk in Japanese |
制限公開データの利用者一覧
| 研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | データ利用期間 | データセット ID |
|---|---|---|---|---|---|
| 河野 隆志 | 国立がん研究センター研究所 | 日本 | 肺がんの個別化予防に資する遺伝要因の同定を目指す研究 | 2016-02-15 – 2028-12-31 | |
| 吉藤 元 | 臨床免疫学講座, 京都大学医学研究科 | 日本 | 自己免疫疾患関連遺伝因子に関する研究 | 2016-06-06 – 2023-08-02 | |
| 野口 恵美子 | 医学医療系遺伝医学, 筑波大学 | 日本 | グルパール19S（旧茶のしずく抗原）によるアレルギー反応に関連する遺伝子マーカーの探索(H25-088) | 2016-08-25 – 2022-03-07 | |
| 岡田 随象 | 遺伝統計学, 大阪大学大学院医学系研究科 | 日本 | 日本人由来B細胞株DNAのゲノムデータを用いた遺伝統計解析手法の研究 | 2018-09-20 – 2029-03-31 | |
| 野入 英世 | 医学部附属病院, 東京大学 | 日本 | 末期腎不全に至る慢性腎臓病発症・進展要因に関する遺伝子解析 | 2018-12-18 – 2019-09-20 | |
| 野口 恵美子 | 医学医療系, 筑波大学 | 日本 | ・小麦依存性運動誘発アナフィラキシーの原因遺伝子解析とそれに対応する小麦品種の探索 | 2020-02-28 – 2023-04-07 | |
| 野口 恵美子 | 医学医療系, 筑波大学 | 日本 | アレルギー疾患における遺伝要因の探索研究 | 2020-02-28 – 2023-04-06 | |
| 野口 恵美子 | 医学医療系, 筑波大学 | 日本 | アレルギーおよびその関連疾患の発症要因の解明 | 2020-02-28 – 2029-03-31 | |
| 野口 恵美子 | 医学医療系, 筑波大学 | 日本 | 慢性好酸球性炎症疾患の発症・病態に関する網羅的解析研究 | 2021-05-07 – 2030-03-31 | |
| 桐野 洋平 | 幹細胞免疫制御内科学, 横浜市立大学医学部 | 日本 | 免疫チェックポイント阻害剤及び抗CTLA-4抗体による免疫関連有害事象発症の遺伝学的予測法の確立 | 2020-06-10 – 2023-03-15 | |
| 莚田 泰誠 | ファーマコゲノミクス研究チーム, 理化学研究所 生命医科学研究センター | 日本 | 小麦アレルギーの遺伝子多型解析 | 2021-03-26 – 2028-03-31 | |
| Hajime Yoshifuji | Department of Rheumatology and Clinical Immunology, Kyoto University Graduate School of Medicine | 日本 | To impute HLA alleles of patients with autoimmune diseases and healthy people to fine-map the HLA region to clarify the associations between the HLA locus and diseases susceptibility or diseases' phenotypes | 2021-07-26 – 2023-08-02 | |
| 恵美子 野口 | 医学医療系遺伝医学, 筑波大学 | 日本 | 食物アレルギーの発症要因の解明 | 2021-12-08 – 2029-03-31 | |
| 吉藤 元 | 内科学講座臨床免疫学, 京都大学大学院医学研究科 | 日本 | 自己免疫疾患関連遺伝因子に関する研究 | 2022-06-23 – 2025-06-16 | |
| 野口 恵美子 | 医学医療系遺伝医学, 筑波大学 | 日本 | 炎症性肺疾患の遺伝素因に関する研究 | 2022-09-21 – 2027-03-31 | |
| 山崎 慶子 | 公衆衛生学, 千葉大学大学院医学研究院 | 日本 | 炎症性腸疾患における分子標的薬の効果予測システムの構築 | 2022-11-15 – 2030-03-31 | |
| 福永 航也 | 医薬安全科学部, 国立医薬品食品衛生研究所 | 日本 | 重篤な皮膚有害事象の診断・治療と遺伝子マーカーに関する研究 | 2023-02-10 – 2026-03-02 | |
| 福永 航也 | 医薬安全科学部, 国立医薬品食品衛生研究所 | 日本 | 薬剤性間質性肺疾患の発症に関連するバイオマーカーの探索研究 | 2023-02-10 – 2026-03-02 | |
| 福永 航也 | 医薬安全科学部, 国立医薬品食品衛生研究所 | 日本 | 薬物性肝障害の発症に関連するバイオマーカーの探索研究 | 2023-02-10 – 2024-04-02 | |
| 福永 航也 | 医薬安全科学部, 国立医薬品食品衛生研究所 | 日本 | 横紋筋融解症の発症に関連するバイオマーカーの探索研究 | 2023-02-10 – 2026-03-02 | |
| 高地 雄太 | 難治疾患研究所ゲノム機能多様性分野, 東京医科歯科大学 | 日本 | 機能性遺伝子多型の網羅的解析を介した多因子疾患の病態解明 | 2023-04-12 – 2028-03-31 | |
| 野口 恵美子 | 医学医療系遺伝医学, 筑波大学 | 日本 | 小麦依存性運動誘発アナフィラキシーの原因遺伝子解析とそれに対応する小麦品種の探索 | 2024-05-09 – 2028-03-31 | |
| 金子 猛 | 呼吸器内科, 横浜市立大学 | 日本 | 新型コロナウイルス感染症の発症に関与する遺伝要因の解明 | 2024-06-19 – 2025-04-04 | |
| 白石 航也 | 臨床ゲノム解析部門, 国立がん研究センター研究所 | 日本 | 肺がんの個別化予防に資する遺伝要因の同定を目指す研究 | 2024-06-24 – 2025-12-15 | |
| 莚田 泰誠 | ファーマコゲノミクス研究チーム, 理化学研究所 生命医科学研究センター | 日本 | 薬疹関連遺伝子の探索 | 2024-08-01 – 2028-03-31 | |
| 石垣 和慶 | ヒト免疫遺伝研究チーム, 理化学研究所 生命医科学研究センター | 日本 | T細胞受容体・B細胞受容体の疾患横断的解析/自己免疫疾患のリスク多型の同定と機能解析 | 2024-12-23 – 2028-03-31 | |
| 野口 恵美子 | 医学医療系遺伝医学, 筑波大学 | 日本 | アレルギー性鼻炎を中心とするアレルギー疾患の遺伝子解析と蛋白質解析に関する研究 | 2024-09-04 – 2030-03-31 | |
| 野口 恵美子 | 遺伝医学, 筑波大学医学医療系 | 日本 | ダニアレルゲン免疫療法の治療効果予測法についての研究 | 2026-06-18 – 2034-03-31 |