研究 ID
hum0017-v1リリース情報
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研究題目
中枢神経原発悪性リンパ腫のエクソーム解析
研究概要
- 目的
- 中枢神経原発悪性リンパ腫(primary central nervous system lymphoma: PCNSL)は原因不明な脳内リンパ腫であり、有効な治療に乏しい。全エクソン配列解析を行うことでタンパクコード遺伝子の体細胞変異を発見し、PCNSLのがん化機構の解明を目指す。
- 研究方法
- 脳外科手術によって摘出されたPCNSL試料と、同一患者より得られた末梢血単核球(計41ペア)よりゲノムDNAおよびRNAを抽出し、Exome解析、RNA-seq解析を行った。
- 対象
- PCNSL患者:41症例
データセット
| カート | データセット ID | データの種類 | 解析手法 | アクセス制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|---|---|
| JGAD000021 | NGS(Exome 、RNA-seq) |
| 制限公開(Type I) | 2020-09-28 |
提供者
- 研究代表者
- 間野 博行
- 所属機関
- 国立がん研究センター研究所 細胞情報学分野
研究プロジェクト情報
| 研究プロジェクト名 | URL |
|---|---|
PCNSL Genomic Analysis |
助成金情報
| 科研費・助成金名 | 研究課題名 | 研究課題番号 |
|---|---|---|
日本医療研究開発機構 革新的先端研究開発支援事業インキュベートタイプ(AMED-LEAP) | がん治療標的探索プロジェクト | N/A |
関連論文
| タイトル | DOI | データセット ID |
|---|---|---|
Genomic characterization of primary central nervous system lymphoma |
制限公開データの利用者一覧
| 研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | データ利用期間 | データセット ID |
|---|---|---|---|---|---|
| Li WEI | National Key Laboratory of Birth Defects and Reproductive Health, Chongqing Institute of Population and Family Planning | 中国 | Molecular understanding of Primary Central Nervous System Lymphoma (PCNSL) using single cell genomics | 2016-11-25 – 2022-11-02 | |
| Mosquera Orgueira Adrian | Lymphoproliferative Diseases Research Group, Insititute for Research in Health at Santiago de Compostela (IDIS) | スペイン | An integrative analysis of Primary Central Nervous Systema Lymphoma (PCNSL) genomes | 2017-04-04 – 2023-08-21 | |
| Margaret Shipp | Division of Hematologic Neoplasia, Dana-Farber Cancer Institute | アメリカ合衆国 (マサチューセッツ州) | Development of a comprehensive approach to analyze genetic bases for immune evasion in Primary Central Nervous System Lymphoma | 2017-11-29 – 2023-08-22 | |
| 千葉 滋 | 血液内科, 筑波大学 | 日本 | 中枢神経原発悪性リンパ腫の発症を支持する脳内免疫環境細胞の同定 | 2019-02-12 – 2024-05-01 | |
| 小川 誠司 | 腫瘍生物学講座, 京都大学大学院医学研究科 | 日本 | 造血器腫瘍における遺伝子異常の網羅的解析 | 2020-01-09 – 2022-12-19 | |
| Jessica Okosun | Barts Cancer Institute, Queen Mary University of London | イギリス | Dissecting the molecular heterogeneity and evolution of central nervous system lymphomas | 2021-11-11 – 2026-03-02 | |
| Wei Hua | Neurosurgery, Huashan Hospital, Fudan University | 中国 | Genomic and molecular characterization of primary central nervous system lymphoma | 2022-06-13 – 2023-10-11 | |
| 齋藤 竜太 | 脳神経外科学, 名古屋大学大学院医学系研究科 | 日本 | 脳腫瘍の発生、進展に関わる遺伝子異常と腫瘍微小環境の形成に関する研究 | 2022-10-13 – 2027-03-31 | |
| 浜田 道昭 | 浜田研究室, 理工学術院, 早稲田大学 | 日本 | RNA標的創薬データベースの構築 | 2023-01-05 – 2027-10-31 | |
| 飯田 真介 | 血液・腫瘍内科, 名古屋市立大学病院 | 日本 | びまん性大細胞型B 細胞性リンパ腫 (DLBCL) の中枢神経浸潤のリスク因子に関する解析 | 2024-03-05 – 2025-04-14 | |
| 片岡 圭亮 | 分子腫瘍学分野, 国立がん研究センター研究所 | 日本 | 中枢神経原発悪性リンパ腫を対象とした予後予測指標の多施設共同観察研究 | 2025-09-02 – 2027-12-31 |