NBDC Research ID: hum0580.v1
研究内容の概要
目的： 慶應義塾大学医学部産婦人科バイオバンク（Keio Women’s Health Biobank）では、患者試料を収集して保管し、将来実施される解析研究に対して試料および診療情報を適切に分譲することを目指している。また、婦人科腫瘍のオルガノイド（ヒトの正常組織や病変組織を体外で三次元培養した細胞）を、臨床情報や各種オミクス情報、薬剤感受性試験の情報などを付随した形で国内外の研究機関・製薬企業などに分譲していくことで、医学研究に貢献するための研究推進基盤の構築を目指す。
方法： 全ゲノムシークエンス
対象： 子宮頸部胃型腺がん 1症例
URL： http://www.obgy.med.keio.ac.jp/index.php
| データID | 内容 | 制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|
| JGAS000796 | NGS（WGS） | 制限公開（Type I） | 2026/05/20 |
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分子データ
| 対象 |
子宮頸部胃型腺がん（ICD10：C539）：1症例 腫瘍組織：2検体 腫瘍組織より作製したオルガノイド：2検体 正常組織（PBMC）：1検体 |
| 規模 | WGS |
| 対象領域（Target Captureの場合） | - |
| Platform | Illumina [NovaSeq 6000] |
| ライブラリソース | 腫瘍組織、腫瘍オルガノド、ならびに正常組織から抽出したDNA |
| 検体情報（購入の場合） | - |
| ライブラリ作製方法（キット名） | NovaSeq 6000 S4 Reagent Kit v1.5 |
| 断片化の方法 | 超音波断片化 |
| ライブラリ構築方法 | Paired-end |
| リード長（除：バーコード、アダプタ、プライマー、リンカー） | 150 bp |
| Japanese Genotype-phenotype Archive Dataset ID | JGAD000938 |
| 総データ量 | 386.7 GB（fastq） |
| コメント（利用にあたっての制限事項） | NBDC policy |
提供者情報
研究代表者： 菅原 正貴
所 属 機 関： 慶應義塾大学医学部 産婦人科学教室
プロジェクト/研究グループ名：-
URL: http://www.obgy.med.keio.ac.jp/index.php
科研費/助成金（Research Project Number）：
| 科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
|---|---|---|
| 科学研究費助成事業 基盤研究（C） | 腫瘍浸潤リンパ球療法における抗腫瘍効果の高いTIL培養法の開発 | 24K12609 |
関連論文
| タイトル | DOI | データID | |
|---|---|---|---|
| 1 | Establishment and genomic characterization of patient-derived organoids from gastric-type cervical adenocarcinoma | doi: 10.3802/jgo.2026.37.e101 | JGAD000938 |
| 2 |
制限公開データの利用者一覧
| 研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | 利用データID | 利用期間 |
|---|---|---|---|---|---|
