NBDC Research ID: hum0436.v1

 

研究内容の概要

目的: 自閉スペクトラム症(Autism Spectrum Disorder:ASD)と対照者間の小脳組織における遺伝子発現の違いを年齢グループ別に分けて調査する

方法: RNA-seq解析によるmRNA の年齢別発現量ならびにアイソフォーム発現の調査

対象: 自閉症16症例、対照患者17名

 

データID内容制限公開日
JGAS000668 NGS(RNA-seq) 制限公開(Type I) 2024/02/06

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分子データ

JGAS000668

対象

自閉症(ICD10:F84.0):16症例

対照者:17名

規模 RNA-seq
対象領域(Target Captureの場合) -
Platform Illumina [HiSeq 2000]
ライブラリソース 小脳組織から抽出したRNA
検体情報(購入の場合) NIH neurobiobank
ライブラリ作製方法(キット名) TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit
断片化の方法 超音波断片化
ライブラリ構築方法 Paired-end
リード長(除:バーコード、アダプタ、プライマー、リンカー) 100 bp
Japanese Genotype-phenotype Archive Dataset ID JGAD000798
総データ量 273.8 GB(fastq)
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提供者情報

研究代表者:丸井 徹也

所 属 機 関:東京大学大学院 新領域創成科学研究科

プロジェクト/研究グループ名:-

科研費/助成金(Research Project Number):

科研費・助成金名タイトル研究課題番号

 

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研究代表者所属機関国・州名研究題目利用データID利用期間