NBDC Research ID: hum0436.v1
研究内容の概要
目的: 自閉スペクトラム症(Autism Spectrum Disorder:ASD)と対照者間の小脳組織における遺伝子発現の違いを年齢グループ別に分けて調査する
方法: RNA-seq解析によるmRNA の年齢別発現量ならびにアイソフォーム発現の調査
対象: 自閉症16症例、対照患者17名
データID | 内容 | 制限 | 公開日 |
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JGAS000668 | NGS(RNA-seq) | 制限公開(Type I) | 2024/02/06 |
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分子データ
対象 |
自閉症(ICD10:F84.0):16症例 対照者:17名 |
規模 | RNA-seq |
対象領域(Target Captureの場合) | - |
Platform | Illumina [HiSeq 2000] |
ライブラリソース | 小脳組織から抽出したRNA |
検体情報(購入の場合) | NIH neurobiobank |
ライブラリ作製方法(キット名) | TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit |
断片化の方法 | 超音波断片化 |
ライブラリ構築方法 | Paired-end |
リード長(除:バーコード、アダプタ、プライマー、リンカー) | 100 bp |
Japanese Genotype-phenotype Archive Dataset ID | JGAD000798 |
総データ量 | 273.8 GB(fastq) |
コメント(利用にあたっての制限事項) | NBDC policy |
提供者情報
研究代表者:丸井 徹也
所 属 機 関:東京大学大学院 新領域創成科学研究科
プロジェクト/研究グループ名:-
科研費/助成金(Research Project Number):
科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
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関連論文
タイトル | DOI | データID | |
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制限公開データの利用者一覧
研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | 利用データID | 利用期間 |
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