NBDC Research ID: hum0436.v1
研究内容の概要
目的： 自閉スペクトラム症（Autism Spectrum Disorder：ASD）と対照者間の小脳組織における遺伝子発現の違いを年齢グループ別に分けて調査する
方法： RNA-seq解析によるmRNA の年齢別発現量ならびにアイソフォーム発現の調査
対象： 自閉症16症例、対照患者17名
| データID | 内容 | 制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|
| JGAS000668 | NGS（RNA-seq） | 制限公開（Type I） | 2024/02/06 |
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分子データ
| 対象 |
自閉症（ICD10：F84.0）：16症例 対照者：17名 |
| 規模 | RNA-seq |
| 対象領域（Target Captureの場合） | - |
| Platform | Illumina [HiSeq 2000] |
| ライブラリソース | 小脳組織から抽出したRNA |
| 検体情報（購入の場合） | NIH neurobiobank |
| ライブラリ作製方法（キット名） | TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit |
| 断片化の方法 | 超音波断片化 |
| ライブラリ構築方法 | Paired-end |
| リード長（除：バーコード、アダプタ、プライマー、リンカー） | 100 bp |
| Japanese Genotype-phenotype Archive Dataset ID | JGAD000798 |
| 総データ量 | 273.8 GB（fastq） |
| コメント（利用にあたっての制限事項） | NBDC policy |
提供者情報
研究代表者：丸井 徹也
所 属 機 関：東京大学大学院 新領域創成科学研究科
プロジェクト/研究グループ名：-
科研費/助成金（Research Project Number）：
| 科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
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関連論文
| タイトル | DOI | データID | |
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制限公開データの利用者一覧
| 研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | 利用データID | 利用期間 |
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