NBDC Research ID: hum0263.v1
研究内容の概要
目的： 若年性骨髄単球性白血病のリスク層別化のための、Infinium® HumanMethylation450 BeadChip（Illumina）に代わる、簡便かつ堅牢性の保持された解析手法の開発
方法： NGSを用いた全ゲノムメチル化解析の方法であるDREAM法を用いて、 若年性骨髄単球性白血病のメチル化解析を行った
対象： 若年性骨髄単球性白血病
| データID | 内容 | 制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|
| JGAS000292 | NGS（DREAM-seq） | 制限公開（Type I） | 2023/07/24 |
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分子データ
| 対象 |
若年性骨髄単球性白血病（ICD10：C933）：149症例（167検体） 16症例については複数回解析を実施（34検体） |
| 規模 | DREAM-seq |
| 対象領域（Target Captureの場合） | - |
| Platform | Illumina [HiSeq 2500] |
| ライブラリソース | 腫瘍組織から抽出したDNA |
| 検体情報（購入の場合） | - |
| ライブラリ作製方法（キット名） | NEBNext Ultra II DNA Library Prep Kit for Illumina |
| 断片化の方法 | 酵素反応 |
| ライブラリ構築方法 | Paired-end |
| リード長（除：バーコード、アダプタ、プライマー、リンカー） | 150bp |
| Japanese Genotype-phenotype Archive Dataset ID | JGAD000398 |
| 総データ量 | 513.6 GB（fastq） |
| コメント（利用にあたっての制限事項） | NBDC policy |
提供者情報
研究代表者： 髙橋 義行
所 属 機 関： 名古屋大学大学院医学系研究科 小児科学
プロジェクト/研究グループ名： -
科研費/助成金（Research Project Number）：
| 科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
|---|---|---|
| 科学研究費助成事業 基盤研究（C） | 次世代シーケンサーを用いた若年性骨髄単球性白血病のメチル化解析法の開発 | 18K07816 |
関連論文
| タイトル | DOI | データID | |
|---|---|---|---|
| 1 | Simple and robust methylation test for risk stratification of patients with juvenile myelomonocytic leukemia | doi: 10.1182/bloodadvances.2021005080 | JGAD000398 |
| 2 |
制限公開データの利用者一覧
| 研究代表者 | 所属機関 | 利用データID | 利用期間 |
|---|---|---|---|
