NBDC Research ID: hum0311.v1

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研究内容の概要

目的： バイオバンク・ジャパン（BBJ）は、東京大学医科学研究所内に設置された臨床情報と生体試料（DNA・血清）のバイオバンクで、平成15（2003）年に委託事業として出発した「オーダーメイド医療実現化プロジェクト」により国内12協力医療機関と協力して収集された47疾患・約20万人（第一コホート）、並びに平成25（2013）年度に開始した「オーダーメイド医療の実現プログラム」により同様の方法で収集された38疾患・約6.7万人（第二コホート）からなる我が国の重要な研究基盤である。 本研究ではBBJが管理する試料・臨床情報及びゲノム情報のさらなる利活用を目指して、試料・情報の保管、管理、提供を継続して実施するとともに、生体試料やゲノム情報、臨床情報を用いて疾患のリスクや予後、薬剤感受性に関わるバイオマーカーを同定し、個別化医療に貢献する。

方法： Asian Screening Array （ASA-24v1-0_A2）による塩基配列決定

対象： BBJ第一コホート　11,716人、BBJ第二コホート　42,689人

URL： https://biobankjp.org/

 

データID内容制限公開日
JGAS000412 BBJ第一コホート11,716名、BBJ第二コホート42,689名のGenotypeデータ 制限公開（Type I） 2021/11/30

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分子データ

JGAS000412
対象

BBJ第一コホート（47疾患）：11,716名

BBJ第二コホート（38疾患）：42,689名

ICD10：C34, C15, C16, C18-C21, C22, C25, C23, C24, C61, C50, C53, C54, C56, C81-C86, C90-C93, I63, G45.9, I67.1, G40, J45, A15-A19, J44.9, J84.1-9, I21.0-9, I20.0, I20.1, I20.8, I20.9, R00, I44.0-3, I45.5-6, I47-I49, I50, I70.9, B18.1, B18.2, K74.6, N04, N20-N23, M80-M81, E10, E11, E88.8, E78.0-5, E78.8-9, E05.0, M05-M06, J30.1, L91.0, L20, L51.1-2, L27.0, D25, N80, R56.0, H40, H25-H26, K05, G12.2, I61, C64
規模 genome wide SNPs
対象領域（Target Captureの場合） -
Platform Illumina [Asian Screening Array (ASA-24v1-0_A2)]
ソース 末梢血（一部唾液）から抽出したDNA
検体情報（購入の場合） -
調整試薬（キット名、バージョン） Infinium Asian Screening Array-24 v1.0 BeadChip Kit
遺伝子型決定アルゴリズム（ソフトウェア） GenomeStudio
マーカー数（QC後） 657,060 SNVs（GRCh38）
Japanese Genotype-phenotype Archive Data set ID JGAD000529
総データ量 1,020 GB（idat、csv、plink binary）
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提供者情報

研究代表者： 松田 浩一

所 属 機 関： 東京大学大学院 新領域創成科学研究科

プロジェクト/研究グループ名：利活用を目的とした日本疾患バイオバンクの運営・管理

URL： https://biobankjp.org/

科研費/助成金（Research Project Number）：

科研費・助成金名タイトル研究課題番号
日本医療研究開発機構（AMED） ゲノム医療実現バイオバンク利活用プログラム（B-Cure） 利活用を目的とした日本疾患バイオバンクの運営・管理 JP20km0605001

 

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タイトルDOIデータID
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制限公開データの利用者一覧

研究代表者所属機関研究題目利用データID利用期間