NBDC Research ID: hum0173.v1
研究内容の概要
目的： 遺伝要因および環境要因が子どもの健康に与える影響の探索。 胎内および出生後の健康状態と環境要因を調査し、疾患に関連するエピゲノム変化の同定、腸内細菌叢の解析、疾患の予測バイオマーカーの確立を通して、慢性疾患リスク低減に役立つような早期の予防的介入方法を探索し、次世代の健康増進に役立てる。
方法： Reduced Representation Bisulfite Sequencing（RRBS）
対象： 臍帯組織（正常分娩）
| データID | 内容 | 制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|
| JGAS000171 | NGS（RRBS） | 制限公開（Type I） | 2019/04/23 |
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分子データ
| 対象 | 臍帯組織（正常分娩）：30検体 |
| 規模 | RRBS |
| 対象領域（Target Captureの場合） | - |
| Platform | Illumina [NextSeq] |
| ライブラリソース | 臍帯組織から抽出したDNA |
| 検体情報（購入の場合） | - |
| ライブラリ作製方法（キット名） | RRBS法（Ovation RRBS Methyl-Seq System 1-16、EpiTect Fast Bisulfite Conversion kits） |
| 断片化の方法 | 酵素反応（MspI） |
| ライブラリ構築方法 | Single-end |
| リード長（除：バーコード、アダプタ、プライマー、リンカー） | 75 bp |
| Japanese Genotype-phenotype Archive Dataset ID | JGAD000249 |
| 総データ量 | 44 GB（bam [ref：GRCh38]） |
| コメント（利用にあたっての制限事項） | NBDC policy |
提供者情報
研究代表者： 森 千里
所 属 機 関： 千葉大学・予防医学センター
プロジェクト/研究グループ名： Chiba Study of Mother and Child Health (C-MACH)
URL： http://cpms.chiba-u.jp/kids/
科研費/助成金（Research Project Number）：
| 科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
|---|---|---|
| 科学研究費助成事業 基盤研究（A） | マルチオミクス指標を用いた児の健康影響評価法と胎児期からの新しい予防医学の確立 | 16H01781 |
関連論文
| タイトル | DOI | データID | |
|---|---|---|---|
| 1 | Chiba study of Mother and Children's Health (C-MACH): cohort study with omics analyses. | doi: 10.1136/bmjopen-2015-010531 | JGAD000249 |
| 2 | DNA methylome of human neonatal umbilical cord: Enrichment of differentially methylated regions compared to umbilical cord blood DNA at transcription factor genes involved in body patterning and effects of maternal folate deficiency or children’s sex. | doi: 10.1371/journal.pone.0214307 | JGAD000249 |
制限公開データの利用者一覧
| 研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | 利用データID | 利用期間 |
|---|---|---|---|---|---|
