NBDC Research ID: hum0167.v1
研究内容の概要
目的： 血清尿酸値（SUA）の変動に関連する遺伝要因を同定する
方法： GWASメタ解析
対象： ３つの日本人コホート研究への参加者（日本多施設共同コホート研究【J-MICC study】：10,621名、北名古屋ゲノム疫学研究【KING study】：2,095名、バイオバンクジャパン【BBJ】：109,029名）
URL： http://ndmc-ipb.browse.jp/research.shtml
| データID | 内容 | 制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|
| hum0167.v1.meta.v1 | SUAレベルに関するGWASのメタ解析 | 非制限公開 | 2019/07/23 |
※リリース情報はこちら
※論文等でデータベースからダウンロードしたデータを含む結果を公表する際には、下記文献を引用いただくか、NBDCヒトデータベースに登録されたデータを利用した旨について謝辞（Acknowledgement）に記載して下さい。記載例はこちら。
分子データ
| 対象 |
[GWAS-1] J-MICC study：10,621名 [GWAS-2] KING study：2,095名 [GWAS-3] BBJ：109,029名 |
| 規模 | genome wide SNVs |
| 対象領域（Target Captureの場合） | - |
| Platform | Illumina [HumanOmniExpressExome-8、660W-Quad、Omni2.5-8、OmniExpress-12、OmniExpress-24、HumanOmniExpressExome、HumanOmniExpress、HumanExome BeadChip] |
| ソース | 末梢血から抽出したgDNA |
| 検体情報（購入の場合） | - |
| 調整試薬（キット名、バージョン） | HumanOmniExpressExome-8、660W-Quad、Omni2.5-8、OmniExpress-12、OmniExpress-24、HumanOmniExpressExome、HumanOmniExpress、HumanExome BeadChip kit |
| 遺伝子型決定アルゴリズム（ソフトウェア） |
SHAPEIT3 & minimac3 (1000G phase3v5; individuals of all ancestry) / MACH & minimac (1000G phase1v3; individuals of East Asian ancestry) GenomeStudio / BeadStudio |
| 関連解析（ソフトウェア） |
EPACTS / mach2qtl METAL |
| フィルタリング | Post-imputation QC: Imputation quality (Rsq) < 0.7 in BBJ / Rsq < 0.3 in othersまたはMAF < 0.005を除外 |
| マーカー数(QC後) | 5,864,938 SNPs（hg19） |
| NBDC Dataset ID |
（データのダウンロードは上記Dataset IDをクリックしてください） |
| 総データ量 | 80 MB（tsv.zip） |
| コメント（利用にあたっての制限事項） | NBDC policy |
提供者情報
研究代表者： 松尾 洋孝
所 属 機 関： 防衛医科大学校 分子生体制御学講座
プロジェクト/研究グループ名：
科研費/助成金（Research Project Number）：
| 科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
|---|---|---|
| 科学研究費助成事業 基盤研究（B） | 分子遺伝疫学的解析による痛風の病態解明とゲノムテーラーメイド医療への応用 | 25293145 |
| 科学研究費助成事業 挑戦的萌芽研究 | 分子遺伝疫学的解析を活用したヒト腸管上皮における尿酸排泄機構の解明 | 15K15227 |
| 科学研究費助成事業 基盤研究（B） | 国際コンソーシアムを活用した日本発の痛風の分子疫学研究による予防医学への応用 | 17H04128 |
| 科学研究費助成事業 新学術領域研究（研究領域提案型） | がん研究分野の特性等を踏まえた支援活動 | 221S0001 |
| 科学研究費助成事業 特定領域研究 | 分子疫学コーホート研究の支援に関する研究 | 17015018 |
| 科学研究費助成事業 新学術領域研究（研究領域提案型）『学術研究支援基盤形成』 | コホート・生体試料支援プラットフォーム | 16H06277 |
| 科学研究費助成事業 基盤研究（B） | 生活習慣病の遺伝子リスクマーカーの信頼性に関する検証的疫学研究 | 24390169 |
| 科学研究費助成事業 基盤研究（B） | 生活習慣病の包括的リスク診断アルゴリズムの構築と検証的疫学研究 | 16H05250 |
| 科学研究費助成事業 基盤研究（B） | 地域住民を対象としたエピゲノム疫学研究基盤の構築 | 25293144 |
| 科学研究費助成事業 若手研究（B） | 発現ネットワーク解析とエピゲノム情報に基づくアディポネクチン発現パスウェイの解明 | 15K19242 |
| 科学研究費助成事業 基盤研究（C） | 新たな代謝相関の提案に向けたELOVL2プロモーター領域DNAメチル化制御の解明 | 18K06942 |
関連論文
| タイトル | DOI | データID | |
|---|---|---|---|
| 1 | Genome-wide meta-analysis identifies multiple novel loci associated with serum uric acid levels in Japanese individuals | doi: 10.1038/s42003-019-0339-0 | hum0167.v1.meta.v1 |
| 2 |
