NBDC Research ID: hum0156.v1
研究内容の概要
目的： 食道がんに対する化学放射線療法の耐性機構を明らかにする
方法： 内視鏡生検もしくは切除検体から採取した腫瘍組織と末梢血（正常組織）から抽出したDNAを用いた全エクソンシーケンス解析
対象： 化学放射線治療を受けた食道がん33症例
| データID | 内容 | 制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|
| JGAS000227 | NGS（Exome） | 制限公開（Type I） | 2021/07/30 |
※リリース情報はこちら
※制限公開データの利用にあたっては、利用申請が必要です。申請方法はこちら。
分子データ
| 対象 |
食道がん（ICD10：C159）：33症例 腫瘍組織：52検体 末梢血：33検体 |
| 規模 | Exome |
| 対象領域（Target Captureの場合） | - |
| Platform | Illumina [HiSeq 2500] |
| ライブラリソース | 食道がんの腫瘍組織および末梢血から抽出したDNA |
| 検体情報（購入の場合） | - |
| ライブラリ作製方法（キット名） | Agilent SureSelect XT Human All Exon V5+Reg |
| 断片化の方法 | 超音波断片化（Covaris） |
| ライブラリ構築方法 | Paired-end |
| リード長（除：バーコード、アダプタ、プライマー、リンカー） | 100 bp |
| Japanese Genotype-phenotype Archive Dataset ID | JGAD000319 |
| 総データ量 | 1 TB （fastq） |
| コメント（利用にあたっての制限事項） | NBDC policy |
提供者情報
研究代表者： 三森 功士
所 属 機 関： 九州大学病院 別府病院 外科
プロジェクト/研究グループ名： -
URL： https://www.beppu.kyushu-u.ac.jp/gekareview/
科研費/助成金（Research Project Number）：
| 科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
|---|---|---|
| 科学研究費助成事業 基盤研究（C） | 化学放射線耐性を生む食道癌ゲノム・免疫応答のクローン進化の解明 | 19K08123 |
| 科学研究費助成事業 基盤研究（C） | 食道癌ゲノム・エピゲノムの腫瘍内不均一性解析による化学放射線療法耐性機構の解明 | 16K10397 |
| 科学研究費助成事業 若手研究（B） | 次世代シークエンサーを用いた遺伝子統合解析による食道癌化学放射線療法耐性の解明 | 26861003 |
関連論文
| タイトル | DOI | データID | |
|---|---|---|---|
| 1 | The Evolving Genomic Landscape of Esophageal Squamous Cell Carcinoma Under Chemoradiotherapy | doi: 10.1158/0008-5472.CAN-21-0653 | JGAD000319 |
| 2 |
制限公開データの利用者一覧
| 研究代表者 | 所属機関 | 研究題目 | 利用データID | 利用期間 |
|---|---|---|---|---|
