NBDC Research ID: hum0117.v1
研究内容の概要
目的： アルツハイマー病における神経細胞特異的メチル化変化の検出
方法： Illumina Infinium® Human Methylation 450K BeadChip
対象： アルツハイマー病30症例、対照健常者30名
| データID | 内容 | 制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|
| JGAS000125 | メチル化アレイ | 制限公開（Type I） | 2017/12/11 |
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分子データ
| 対象 |
アルツハイマー病（ICD10：G309）：30症例 対照健常者：30名 |
| 規模 | メチル化アレイ |
| 対象領域（Target Captureの場合） | - |
| Platform | Illumina Infinium® Human Methylation 450K BeadChip |
| ソース | 剖検脳組織から抽出した神経細胞核由来のDNA |
| 検体情報（購入の場合） | - |
| 調整試薬（キット名、バージョン） |
バイサルファイト変換：EZ DNA Methylation Kit（Zymo Research） メチル化解析：Infinium® Human Methylation 450K BeadChip（Illumina） |
| メチル化率決定アルゴリズム（ソフトウェア） | iScan scanner（Illumina） |
| フィルタリング | - |
| マイクロアレイ標準化方法 | - |
| プローブ数 | 487,557 プローブ（raw data） |
| Japanese Genotype-phenotype Archive Dataset ID | JGAD000136 |
| 総データ量 | 1 TB（idat） |
| コメント（利用にあたっての制限事項） | NBDC policy |
提供者情報
研究代表者： 岩田 淳
所 属 機 関： 東京大学医学部附属病院 神経内科
プロジェクト/研究グループ名： -
科研費/助成金（Research Project Number）：
| 科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
|---|---|---|
| 科学研究費助成事業 基盤研究（B） | 変性性認知症の新規病態解明のためのneuro-epigenetics方法論の応用 | 16H05319 |
| 科学研究費助成事業 若手研究（B） | 新規アルツハイマー病モデルの開発とDNA傷害の解析 | 17K16113 |
| 日本医療研究開発機構（AMED） 脳科学研究戦略推進プログラム | 孤発性アルツハイマー病アミロイド蓄積の原因に即した治療薬と診断用バイオマーカーの開発 | JP16dm0107069 |
関連論文
| タイトル | DOI | データID | |
|---|---|---|---|
| 1 | Neuron-specific methylome analysis reveals epigenetic regulation and tau-related dysfunction of BRCA1 in Alzheimer's disease. | doi: 10.1073/pnas.1707151114 | JGAD000136 |
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制限公開データの利用者一覧
| 研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | 利用データID | 利用期間 |
|---|---|---|---|---|---|
