研究内容の概要

目的： アスベスト曝露によって発症する悪性胸膜中皮腫の網羅的ゲノム解析により新規分子標的治療法候補分子の同定を行うとともに、新たな分子診断・治療法の開発を目指す

方法： 悪性胸膜中皮腫の外科手術検体あるいは樹立した中皮腫細胞株、および、同一症例の末梢血より抽出したゲノムDNAを用いた全エクソームシークエンス解析

対象： 悪性胸膜中皮腫38症例

データID	内容	制限	公開日
JGAS000062	NGS（Exome）	制限公開（Type I）	2016/07/20

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分子データ


対象	悪性胸膜中皮腫：38症例（腫瘍組織および非腫瘍組織ペア：76検体）
規模	Exome
対象領域（Target Captureの場合）	-
Platform	Illumina [HiSeq 2000/2500]
ライブラリソース	悪性胸膜中皮腫患者の外科手術検体あるいは樹立した中皮腫細胞株より抽出したDNA（腫瘍組織）同一症例の末梢血から抽出したDNA（非腫瘍組織）
検体情報（購入の場合）	-
ライブラリ作製方法（キット名）	SureSelect Human All Exon V4 or V5 plus lncRNA （Agilent社）
断片化の方法	超音波断片化（Covaris E220）
ライブラリ構築方法	Paired-end
リード長（除：バーコード、アダプタ、プライマー、リンカー）	100 bp x 2
Japanese Genotype-phenotype Archive Dataset ID	JGAD000062
総データ量	596 GB（bam [76 files / ref: hg19]）
コメント（利用にあたっての制限事項）	NBDC policy

研究代表者： 中野孝司

所属機関： 兵庫医科大学呼吸器内科

プロジェクト/研究グループ名： 次世代がん研究シーズ戦略的育成プログラム

URL： http://hdc-tsrg.com/

科研費/助成金（Research Project Number）：

科研費・助成金名	タイトル	研究課題番号
日本医療研究開発機構（AMED）次世代がん研究シーズ戦略的育成プログラム（P-DIRECT）	分子プロファイリングによる新規標的同定を通じた難治がん治療法開発（悪性中皮腫のプロファイリングによる新規分子標的の同定）	JP15cm0106068

	タイトル	DOI	データID
1	-	-	-

研究代表者	所属機関	利用データID	利用期間