NBDC Research ID: hum0039.v1
研究内容の概要
目的： 消化管間質腫瘍のチロシンキナーゼ阻害剤に対する獲得耐性機構の解明
方法： 腫瘍のエキソーム解析
対象： イマチニブに対して病理学的に耐性と診断された消化管間質腫瘍症例
| データID | 内容 | 制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|
| JGAS000039 | NGS（Exome） | 制限公開（Type I） | 2016/12/27 |
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分子データ
| 対象 |
イマチニブに対して病理学的に耐性と診断された 消化管間質腫瘍（原発腫瘍、体制腫瘍）：4症例 |
| 規模 | Exome |
| 対象領域（Target Captureの場合） | - |
| Platform | Illumina [HiSeq1500] |
| ライブラリソース | 切除腫瘍組織から抽出したgDNA |
| 検体情報（購入の場合） | - |
| ライブラリ作製方法（キット名） | SureSelect Human All Exon V5+UTRs |
| 断片化の方法 | 超音波断片化（Covaris） |
| ライブラリ構築方法 | Paired-end |
| リード長（除：バーコード、アダプタ、プライマー、リンカー） | 101 bp |
| Japanese Genotype-phenotype Archive Dataset ID | JGAD000039 |
| 総データ量 | 202 GB（fastq） |
| コメント（利用にあたっての制限事項） | NBDC policy および hum0039 policy |
提供者情報
研究代表者： 高橋 剛
所 属 機 関： 大阪大学大学院 医学系研究科 外科学講座 消化器外科学
プロジェクト/研究グループ名：-
科研費/助成金（Research Project Number）：
| 科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
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