データセット ID
NHA000178
- データの種類
- 微生物ゲノムのMAG・ウイルスのゲノム配列・CRISPR spacer配列
- アクセス制限
- 非制限公開
- 研究
- hum0197
- 公開日
- 2022-12-01
- 更新日
- 2022-12-01
- Secondary ID
- hum0197.v12.MAG.v1
解析手法
Metagenomics
- 材料と対象者
- 日本人腸内微生物ゲノム
JGAS000205/JGAS000260/JGAS000316/JGAS000415/JGAS000530/JGAS000531、公開データ（DRA006684）より取得 - 対象集団日本人
- 試料説明
- JGAS000205/JGAS000260/JGAS000316/JGAS000415/JGAS000530/JGAS000531、DRA006684より取得した配列
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Metagenomics
- 測定対象
- N/A
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
Illumina HiSeq 3000
Illumina NovaSeq 6000 - 解析方法
- metaspades,dastools(metabat2、maxbin2、concoct)によるde novo assembly + binning
- 加工データの種類
- メタゲノムから再構成したゲノム (MAG)
- INSDC配列 Accession
- JGA MAG：20220531NSUB000031HIGH_JGA_JMAG_GENOME_*.acclist（JGAS000205/JGAS000260/JGAS000316/JGAS000415/JGAS000530/JGAS000531）
TPA MAG： EMNX01000001-EMNX01000025、EMNY01000001-EMNY01000068、EMNZ01000001-EMNZ01000149、EMOA01000001-EMOA01000067（DRA006684）