データセット ID
NHA000165
- データの種類
- 特発性過眠症のGWAS
- アクセス制限
- 非制限公開
- 総データ量
- 31.1 MB
- ファイル形式
- XLSX
- ZIP
- 研究
- hum0264
- 公開日
- 2022-02-07
- 更新日
- 2022-02-07
- Secondary ID
- hum0264.v1.gwas.v1
このデータセットに紐づく非制限公開ファイル
| ファイル名 | ラベル | サイズ | URL のコピー |
|---|---|---|---|
| hum0264_ | Dictionary file | 10.0 KB | |
| hum0264_ | 31.1 MB |
解析手法
Genotyping by array
- 材料と対象者
- 特発性過眠症（ICD10：G47.11）：129症例
（オレキシン変異陽性13例、オレキシン変異陰性116例） - 健康状態罹患
- 対象者数129 (人数)
- 疾患
- 特発性過眠症 (G471)
- 試料説明
- 末梢血から抽出したDNA
- 組織末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Genotyping by array
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Genome-Wide Human SNP Array 6.0 Kit
- プラットフォーム
- Affymetrix Genome-Wide Human SNP Array 6.0
- 参照ゲノム
- GRCh37
- QC・フィルタリング
- SNP call rate < 0.97、HWE P < 0.001、MAF < 0.05、non-autosomal chromosomes
- 解析方法
- GeneChip Operating Software (GCOS)、Genotyping Console 4.0
- バリアント数
- 487,321 SNPs
- 表現型データの有無
- あり