データセット ID
NHA000159
- データの種類
- NGS（NAT2ハプロタイプ同定）
- アクセス制限
- 非制限公開
- 総データ量
- 9.6 KB
- ファイル形式
- XLSX
- ZIP
- 研究
- hum0163
- 公開日
- 2021-02-09
- 更新日
- 2021-02-09
- Secondary ID
- hum0163.v2.nat2.v1
このデータセットに紐づく非制限公開ファイル
| ファイル名 | ラベル | サイズ | URL のコピー |
|---|---|---|---|
| hum0163.v2.nat2.v1.zip | 323 B | ||
| hum0163_ | Dictionary file | 9.3 KB |
解析手法
Targeted DNA sequencing
- 材料と対象者
- 精神・神経疾患及びがん患者：計990症例
てんかん（ICD10：G402）・双極性障害（ICD10：F319）：343症例（ラモトリギン投与症例）
統合失調症（ICD10：F209）：454症例
乳がん（ICD10：C509）：65症例（トラスツズマブ投与症例）
大腸がん（ICD10：C189）：83症例（レゴラフェニブ投与症例）
悪性黒色腫（ICD10：C439）：45症例（ニボルマブ投与症例） - 健康状態罹患
- 対象者数990 (人数)
- 疾患
- てんかん (G402)
双極性障害 (F319)
統合失調症 (F209)
乳がん (C509)
大腸がん (C189)
悪性黒色腫 (C439) - 試料説明
- 末梢血から抽出したDNA
- 組織末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Targeted DNA sequencing
- 測定対象
- 薬物動態関連100遺伝子コーディング領域1846variants＋CYP2D6遺伝子のディプロタイプ＋NAT2遺伝子のディプロタイプ
- 試薬キット
- In-house multiplex PCR
- 断片化
- N/A
- プラットフォーム
- Illumina MiSeq
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 250 bp