データセット ID
NHA000130
- データの種類
- DMETおよびダイレクトシークエンス法により決定した変異のGenotype頻度情報
- アクセス制限
- 非制限公開
- 総データ量
- 46.1 KB
- ファイル形式
- ZIP
- 研究
- hum0209
- 公開日
- 2019-12-13
- 更新日
- 2019-12-13
- Secondary ID
- hum0209.v1.var.v1
このデータセットに紐づく非制限公開ファイル
| ファイル名 | ラベル | サイズ | URL のコピー |
|---|---|---|---|
| hum0209_ | 46.1 KB |
解析手法
Genotyping by array
- 材料と対象者
- 関節リウマチ（ICD10：M06.9）：166症例
- 健康状態罹患
- 対象者数166 (人数)
- 疾患
- 関節リウマチ (M069)
- 試料説明
- MTX治療を受けたRA患者の末梢血から抽出したDNA
- 組織末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Genotyping by array
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- DMET Plus Premier Pack Kit
BigDye Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit
BigDye XTerminator Purification Kit - プラットフォーム
- Applied Biosystems 3730xl DNA Analyzer
Applied Biosystems Veriti 96-Well Thermal Cycler
Thermo Fisher Scientific GeneChip Scanner 3000 7G - QC・フィルタリング
- copy number variationにある変異、及び、性染色体上の変異は除く
- 解析方法
- Array：the Affymetrix DMET Console Software
Direct sequencing：The 3730xl DNA Analyzer Software - バリアント数
- 1916 variants
- 加工データの種類
- 変異コール