データセット ID
NHA000085
- データの種類
- SUAレベルに関するGWASのメタ解析
- アクセス制限
- 非制限公開
- 総データ量
- 82.4 MB
- ファイル形式
- XLSX
- ZIP
- 研究
- hum0167
- 公開日
- 2019-07-23
- 更新日
- 2019-07-23
- Secondary ID
- hum0167.v1.meta.v1
このデータセットに紐づく非制限公開ファイル
| ファイル名 | ラベル | サイズ | URL のコピー |
|---|---|---|---|
| header_ | Dictionary file | 9.8 KB | |
| hum0167.v1.meta.v1.zip | 82.4 MB |
解析手法
Genotyping by array
- 材料と対象者
- [GWAS-1]
J-MICC study：10,621名
[GWAS-2]
KING study：2,095名
[GWAS-3]
BBJ：109,029名 - 対象者数121,745 (人数)
- コホートBioBank Japan
- 対象集団日本人
- 試料説明
- 末梢血から抽出したgDNA
- 組織末梢血
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Genotyping by array
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- HumanExome BeadChip Kit
HumanOmni2.5 BeadChip Kit
HumanOmniExpress BeadChip Kit
HumanOmniExpressExome BeadChip Kit - プラットフォーム
- Illumina Human660W-Quad
Illumina HumanExome
Illumina HumanOmni2.5
Illumina HumanOmniExpress
Illumina HumanOmniExpressExome - 参照ゲノム
- GRCh37
- QC・フィルタリング
- Post-imputation QC: Imputation quality (Rsq) < 0.7 in BBJ / Rsq < 0.3 in othersまたはMAF < 0.005を除外
- インピュテーション
- SHAPEIT3 & minimac3 (1000G phase3v5; individuals of all ancestry) / MACH & minimac (1000G phase1v3; individuals of East Asian ancestry)
- 解析方法
- GenomeStudio / BeadStudio
- バリアント数
- 5,864,938 SNPs