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NBDC ヒトデータベース

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現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所(NIG)バイオデータ研究拠点(BSI)ライフサイエンス統合データベース部門(DBCLS)」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

データセット ID

JGAD001119

データの種類
NGS(RNA-seq)
アクセス制限
制限公開(Type I)
研究
hum0608

解析手法

RNA-seq

試料 / 対象者
皮膚悪性黒色腫(ICD10:C43):55症例
腫瘍組織(FFPE標本):55検体
- 爪部悪性黒色腫:43症例
(早期22症例、進行期21症例)
- 非爪部悪性黒色腫:12症例
(進行期 AJCC病期IIB以上、足底型6症例、非末端皮膚型6症例)
  • 健康状態
    罹患
  • 対象者数
    55 (人数)
疾患
  • 皮膚悪性黒色腫
試料説明
腫瘍組織より抽出したRNA
  • 腫瘍 / 非腫瘍
    腫瘍
購入試料の入手元
N/A
実験方法
RNA-seq
対象領域
N/A
試薬キット
SMART-Seq Stranded Kit
断片化
N/A
プラットフォーム
Illumina NovaSeq 6000
Illumina NovaSeq X Plus
リードタイプ
ペアエンド
リード長
150 bp