データセット ID
JGAD001119
- データの種類
- NGS(RNA-seq)
- アクセス制限
- 制限公開(Type I)
- 研究
- hum0608
- DDBJ Search
- JGAD001119 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA-seq
- 試料 / 対象者
- 皮膚悪性黒色腫(ICD10:C43):55症例
腫瘍組織(FFPE標本):55検体
- 爪部悪性黒色腫:43症例
(早期22症例、進行期21症例)
- 非爪部悪性黒色腫:12症例
(進行期 AJCC病期IIB以上、足底型6症例、非末端皮膚型6症例) - 健康状態罹患
- 対象者数55 (人数)
- 疾患
- 皮膚悪性黒色腫
- 試料説明
- 腫瘍組織より抽出したRNA
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 購入試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 対象領域
- N/A
- 試薬キット
- SMART-Seq Stranded Kit
- 断片化
- N/A
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
Illumina NovaSeq X Plus - リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp