データセット ID
JGAD001057
- データの種類
- NGS（RNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 881 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- TXT
- 研究
- hum0575
- 公開日
- 2026-07-16
- 更新日
- 2026-07-16
- DDBJ Search
- JGAD001057 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000913 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA-seq
- 材料と対象者
- 腎がん (ICD10: C64) : 201症例
腫瘍組織：201検体
非腫瘍組織（正常腎皮質）：201検体 - 健康状態罹患
- 対象者数201 (人数)
- 疾患
- 腎がん
- 試料説明
- 腫瘍組織および非腫瘍組織から抽出したRNA
- 組織Renal cortex
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- SureSelect Strand-Specific RNA Library Prep Kit
- 断片化
- 熱処理
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 1500
Illumina HiSeq 2500
Illumina NextSeq 550 - リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 76 bp
- 参照ゲノム
- GRCh38
- マッピング
- HISAT2 ver2.2.1
- マッピング品質
- FastQC
- 解析方法
- FeatureCounts ver2.0.1
- 遺伝子数
- 60,671 (Ensembl ID)
- 加工データの種類
- TPM