データセット ID
JGAD001019
- データの種類
- NGS（Exome、RNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 研究
- hum0553
- DDBJ Search
- JGAD001019 (新しいタブで開きます)
解析手法
WES
- 材料と対象者
- 大腸がん（ICD10：C18, C78.7）：1症例
肝臓転移腫瘍組織から樹立したオルガノイド：4検体 - 健康状態罹患
- 対象者数1 (人数)
- 疾患
- 大腸がん
- 試料説明
- 肝臓転移腫瘍組織から樹立したオルガノイドから抽出したDNA
- 組織肝臓
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Twist Comprehensive Exome Panel
- 断片化
- 超音波断片化（Covaris）
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp
RNA-seq
- 材料と対象者
- 大腸がん（ICD10：C18, C78.7）：1症例
肝臓転移腫瘍組織から樹立したオルガノイド：6検体 - 健康状態罹患
- 対象者数1 (人数)
- 疾患
- 大腸がん
- 試料説明
- 肝臓転移腫瘍組織から樹立したオルガノイドから抽出したRNA
- 組織肝臓、オルガノイド
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit
- 断片化
- 化学的断片化
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リードタイプ
- シングルエンド
- リード長
- 100 bp