データセット ID
JGAD001007
- データの種類
- NGS（Target Capture）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 100 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0552
- 公開日
- 2025-12-24
- 更新日
- 2025-12-24
- DDBJ Search
- JGAD001007 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000864 (新しいタブで開きます)
解析手法
Targeted DNA sequencing
- 材料と対象者
- 腹部大動脈瘤（ICD10：I71.3、I71.4）：44症例
末梢血：44検体 - 健康状態罹患
- 対象者数44 (人数)
- 疾患
- 腹部大動脈瘤
- 試料説明
- 末梢血から抽出したDNA
- 組織末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Targeted DNA sequencing
- 測定対象
- ASXL1（11-13）、ATM（1-63）、CBL（8-9）、CHEK2（2-15）、DNMT3A（1-23）、EZH2（2-20）、GNB1（5-7）、JAK2（12-16）、PHF6（2-10）、PPM1D（6）、RUNX1（1-9）、SF3B1（13-18）、SMC1A（1-25）、SRSF2（2）、TET2（3-11）、TP53（1-11）
カッコ内はExon番号を示す - 試薬キット
- MBC adapter kit for Illumina
VariantPlex - 断片化
- 酵素反応
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq X
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp