2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします
現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです
- 公開日
- 2026-01-06
- 更新日
- 2026-01-06
- 研究
- hum0488
- データの種類
- NGS(WGS、snRNA-seq、snATAC-seq)
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- JGA Study
- JGAS000852
解析手法
WGS
- 材料と対象者
ALS(ICD10: G12.2): 6症例 非ALS: 6症例 凍結脳組織(大脳運動野)、凍結脊髄組織(腰髄L4、L5レベル)
- 実験方法
WGS
- プラットフォーム
Illumina [NovaSeq 6000]
- 試料説明
凍結組織から抽出したDNA
- ライブラリ構築
TruSeq DNA PCR-Free Kit
- 断片化
上記キットに準拠
- リードタイプ
Paired-end
- リード長
150 bp
- JGAデータセットAccession
- 総データ量
1.8 TB(fastq)
- 利用ポリシー
snRNA-seq
- 材料と対象者
ALS(ICD10: G12.2): 6症例 非ALS: 6症例 凍結脳組織(大脳運動野)、凍結脊髄組織(腰髄L4、L5レベル)
- 実験方法
snRNA-seq
- プラットフォーム
Illumina [NovaSeq 6000]
- 試料説明
凍結組織から密度勾配法によって単離した核より抽出したRNA
- ライブラリ構築
Chromium Next GEM Single Cell 3ʹ v3.1
- 断片化
サプライヤー提供プロトコルに準拠
- リードタイプ
Paired-end
- リード長
150 bp
- JGAデータセットAccession
- 総データ量
1.8 TB(fastq)
- 利用ポリシー
snATAC-seq
- 材料と対象者
ALS(ICD10: G12.2): 4症例 非ALS: 4症例 凍結脳組織(大脳運動野)、凍結脊髄組織(腰髄L4、L5レベル)
- 実験方法
snATAC-seq
- プラットフォーム
Illumina [NovaSeq 6000]
- 試料説明
凍結組織から密度勾配法によって単離した核より抽出したDNA
- ライブラリ構築
Chromium Next GEM Single Cell Multiome ATAC + Gene Expression
- 断片化
サプライヤー提供プロトコルに準拠
- リードタイプ
Paired-end
- リード長
150 bp
- JGAデータセットAccession
- 総データ量
1.8 TB(fastq)
- 利用ポリシー