データセット ID
JGAD000994
- データの種類
- NGS（WGS、snRNA-seq、snATAC-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 1.8 TB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0488
- 公開日
- 2026-01-06
- 更新日
- 2026-01-06
- DDBJ Search
- JGAD000994 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000852 (新しいタブで開きます)
解析手法
WGS
- 材料と対象者
- ALS（ICD10：G12.2）：6症例
非ALS：6症例
凍結脳組織（大脳運動野）、凍結脊髄組織（腰髄L4、L5レベル） - 健康状態混在
- 対象者数12 (人数)
- 疾患
- ALS
- 試料説明
- 凍結組織から抽出したDNA
- 組織脳、Spinal cord
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WGS
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- TruSeq DNA PCR-Free Library Prep Kit
- 断片化
- 上記キットに準拠
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp
snRNA-seq
- 材料と対象者
- ALS（ICD10：G12.2）：6症例
非ALS：6症例
凍結脳組織（大脳運動野）、凍結脊髄組織（腰髄L4、L5レベル） - 健康状態混在
- 対象者数12 (人数)
- 疾患
- ALS
- 試料説明
- 凍結組織から密度勾配法によって単離した核より抽出したRNA
- 組織脳、Spinal cord
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- scRNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Chromium Next GEM Single Cell 3' v3.1
- 断片化
- サプライヤー提供プロトコルに準拠
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp
snATAC-seq
- 材料と対象者
- ALS（ICD10：G12.2）：4症例
非ALS：4症例
凍結脳組織（大脳運動野）、凍結脊髄組織（腰髄L4、L5レベル） - 健康状態混在
- 対象者数8 (人数)
- 疾患
- ALS
- 試料説明
- 凍結組織から密度勾配法によって単離した核より抽出したDNA
- 組織脳、Spinal cord
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- scATAC-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Chromium Next GEM Single Cell Multiome ATAC + Gene Expression
- 断片化
- サプライヤー提供プロトコルに準拠
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp