2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします
現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです
JGAD000990
- 公開日
- 2025-12-04
- 更新日
- 2025-12-04
- 研究
- hum0116
- データの種類
- NGS(single cell RNA-seq)
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- JGA Study
- JGAS000848
解析手法
scRNA-seq
- 材料と対象者
AML(ICD10: C920)1症例の純化した白血病細胞を移植した10匹のPDXマウスに健常ドナー5名の臍帯血由来CAR-T細胞(CXCR4強制発現あり/なし: 計10種)を投与し、2.5週間後(肝臓・脾臓)、4週間もしくは5ヶ月後(骨髄)に各組織よりセルソータにて回収した CART-T細胞(健常ドナー5名由来、肝臓・脾臓・骨髄): 12検体 白血病細胞(AML1症例由来、肝臓・脾臓のみ): 6検体
- 実験方法
scRNA-seq
- プラットフォーム
Illumina [NovaSeq 6000]
- 試料説明
CART-T細胞および白血病細胞から抽出したRNA
- ライブラリ構築
Chromium Next GEM Single Cell 5' Kit v2
- 断片化
上記キットに準拠
- リードタイプ
Paired-end
- リード長
150 bp
- JGAデータセットAccession
- 総データ量
1.2 TB(fastq)
- 利用ポリシー