データセット ID
JGAD000990
- データの種類
- NGS（single cell RNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 1.2 TB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0116
- 公開日
- 2025-12-04
- 更新日
- 2025-12-04
- DDBJ Search
- JGAD000990 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000848 (新しいタブで開きます)
解析手法
scRNA-seq
- 材料と対象者
- AML（ICD10：C920）1症例の純化した白血病細胞を移植した10匹のPDXマウスに健常ドナー5名の臍帯血由来CAR-T細胞（CXCR4強制発現あり/なし：計10種）を投与し、2.5週間後（肝臓・脾臓）、4週間もしくは5ヶ月後（骨髄）に各組織よりセルソータにて回収した
CART-T細胞（健常ドナー5名由来、肝臓・脾臓・骨髄）：12検体
白血病細胞（AML1症例由来、肝臓・脾臓のみ）：6検体 - 健康状態混在
- 対象者数6 (人数)
- 疾患
- AML
- 試料説明
- CART-T細胞および白血病細胞から抽出したRNA
- 組織臍帯血
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- scRNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Chromium Next GEM Single Cell 5' v2
- 断片化
- 上記キットに準拠
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp