2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします
現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです
JGAD000986
- 公開日
- 2025-10-20
- 更新日
- 2025-10-20
- 研究
- hum0535
- データの種類
- NGS(ATAC-seq)
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- JGA Study
- JGAS000844
解析手法
ATAC-seq
- 材料と対象者
乾癬(ICD10: L40): 6症例 病変皮膚: 6検体 臨床的治癒皮膚: 6検体 健常皮膚: 5検体
- 実験方法
ATAC-seq
- プラットフォーム
Illumina [NovaSeq 6000]
- 試料説明
皮膚検体から分離した表皮ケラチノサイトより抽出したDNA
- ライブラリ構築
Tagment DNA TDE1 Enzyme and Buffer Kit
- 断片化
Tn5 transposase-mediated tagmentation
- リードタイプ
Paired-end
- リード長
150 bp x 2
- 解析方法
FastQC、Bowtie2、MACS2
- フィルタリング
Bioanalyzer、FastQC
- リファレンス配列
GRCh38
- JGAデータセットAccession
- 総データ量
69.4 GB(bam)
- 利用ポリシー