データセット ID
JGAD000967
- データの種類
- NGS（Target bisulfite-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 331 MB
- ファイル形式
- FASTQ
- TXT
- 研究
- hum0358
- 公開日
- 2025-09-26
- 更新日
- 2025-09-26
- DDBJ Search
- JGAD000967 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000825 (新しいタブで開きます)
解析手法
Methyl-seq
- 材料と対象者
- 子宮頸がん（ICD10：C539）：96症例
腫瘍組織：96検体 - 健康状態罹患
- 対象者数96 (人数)
- 疾患
- 子宮頸がん
- 試料説明
- 腫瘍組織から抽出したDNA
- 組織子宮頸部
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Targeted bisulfite sequencing
- 測定対象
- chr6:29943290-29943607
- 試薬キット
- NEBNext Ultra II DNA Library Prep Kit for Illumina
- 断片化
- PCR
- プラットフォーム
- Illumina MiSeq
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 251 bp
- 参照ゲノム
- GRCh38
- QC・フィルタリング
- Trim Galore（version 0.6.10）
- 解析方法
- BisMark（version 0.24.2）