データセット ID
JGAD000966
- データの種類
- NGS（Exome）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 593 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- TXT
- 研究
- hum0358
- 公開日
- 2025-09-26
- 更新日
- 2025-09-26
- DDBJ Search
- JGAD000966 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000824 (新しいタブで開きます)
解析手法
WES
- 材料と対象者
- 子宮頸がん（ICD10：C539）
96症例：腫瘍組織（96検体） - 健康状態罹患
- 対象者数96 (人数)
- 疾患
- 子宮頸がん
- 試料説明
- 腫瘍組織から抽出したDNA
- 組織子宮頸部
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Library Preparation Enzymatic Fragmentation Kit 2.0
- 断片化
- 酵素反応
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq X Plus
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 151 bp
- 参照ゲノム
- GRCh38
- QC・フィルタリング
- DRAGEN Germline Small Variant Callerのpreconfigured hard-filtering criteria
- 解析方法
- DRAGEN Enrichment pipeline（version 4.1）