データセット ID
JGAD000951
- データの種類
- NGS（Exome）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 971 GB
- ファイル形式
- BAM
- 研究
- hum0517
- 公開日
- 2025-06-18
- 更新日
- 2025-06-18
- DDBJ Search
- JGAD000951 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000809 (新しいタブで開きます)
解析手法
WES
- 材料と対象者
- 子宮体がん（ICD10：C549）：30症例
腫瘍組織 30検体
PDX腫瘍組織 31検体 - 健康状態罹患
- 対象者数61 (検体数)
- 疾患
- 子宮体がん (C549)
- 試料説明
- 腫瘍組織およびPDX腫瘍組織から抽出したDNA
- 組織PDX (患者由来異種移植)
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- SureSelect Clinical Research Panel v2
- 断片化
- 酵素反応
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 75 bp
- 参照ゲノム
- GRCh37
- マッピング
- BWA-MEM（v0.7.15）
- マッピング品質
- Mutect2（GATK v4.1.1.0）で変異コール時にMAPQ<20のリードを除外
- カバレッジ (深度)
- 115x