データセット ID
JGAD000950
- データの種類
- NGS（scRNA-seq/TCRレパトア解析）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 270 GB
- ファイル形式
- BAM
- CSV
- 研究
- hum0519
- 公開日
- 2026-02-10
- 更新日
- 2026-02-10
- DDBJ Search
- JGAD000950 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000808 (新しいタブで開きます)
解析手法
scRNA-seq + scTCR-seq
- 材料と対象者
- シェーグレン症候群（ICD10：M350）：8症例
唾液腺組織：8検体 - 健康状態罹患
- 対象者数8 (混在)
- 疾患
- シェーグレン症候群
- 試料説明
- 唾液腺組織より取得したT細胞より抽出したRNA
- 組織唾液腺、T 細胞
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- scRNA-seq
TCR-seq - 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Chromium Single Cell 5'
- 断片化
- 上記キットに準拠
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq X
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp
- 参照ゲノム
- GRCh38
- マッピング
- Cell Ranger（version 5.0.1）
- QC・フィルタリング
- Cell Ranger（version 5.0.1）
- 解析方法
- Cell Ranger（version 5.0.1）
- 遺伝子数
- 1000–1500 genes (約)
- 加工データの種類
- アライメント