データセット ID
JGAD000949
- データの種類
- NGS（Exome、RNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 31.4 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0401
- 公開日
- 2025-11-26
- 更新日
- 2025-11-26
- DDBJ Search
- JGAD000949 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000807 (新しいタブで開きます)
解析手法
WES
- 材料と対象者
- 組織球肉腫（ICD10：C499）：1症例
腫瘍組織：1検体
非腫瘍組織（筋組織）：1検体
ODX：1検体 - 健康状態罹患
- 対象者数10 (検体数)
- 疾患
- 組織球肉腫
- 試料説明
- 腫瘍組織および非腫瘍組織から抽出したDNA
- 組織筋肉、PDX (患者由来異種移植)
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- SureSelect Human All Exon V6
- 断片化
- 超音波断片化 （Covaris）
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
Illumina NovaSeq X Plus - リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp
RNA-seq
- 材料と対象者
- 組織球肉腫（ICD10：C499）：1症例
腫瘍組織：1検体
非腫瘍組織（筋組織）：1検体
ODX：2検体
合計：4検体 - 健康状態罹患
- 対象者数10 (検体数)
- 疾患
- 組織球肉腫
- 試料説明
- 腫瘍組織および非腫瘍組織から抽出したRNA
- 組織筋肉、PDX (患者由来異種移植)
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- NEBNext Ultra II Directional RNA Library Prep Kit for Illumina
- 断片化
- 化学的断片化
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
Illumina NovaSeq X Plus - リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp