2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします
現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです
JGAD000948
- 公開日
- 2025-11-27
- 更新日
- 2025-11-27
- 研究
- hum0401
- データの種類
- NGS(RNA-seq)
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- JGA Study
- JGAS000806
解析手法
RNA-seq
- 材料と対象者
【JGAS000618】 悪性骨巨細胞腫(ICD10: C419): 1症例 非腫瘍組織(筋肉組織): 1検体 腫瘍組織(2回目手術検体): 1検体 腫瘍組織(3回目手術検体): 1検体 腫瘍組織から作製したオルガノイド: 2検体 腫瘍組織のオルガノイドを移植したxenograftの腫瘍組織: 3検体 【JGAS000806】 滑膜肉腫(ICD10: C499): 3症例 腫瘍組織: 1検体 非腫瘍組織(筋組織): 1検体 ODX: 1検体 合計: 9検体
- 実験方法
RNA-seq
- プラットフォーム
MGI [DNBSEQ-G400/T7]
- 試料説明
腫瘍組織および非腫瘍組織から抽出したRNA
- ライブラリ構築
MGIEasy RNA Directional Library Prep Set
- 断片化
熱処理
- リードタイプ
Paired-end
- リード長
100 bp
- JGAデータセットAccession
滑膜肉腫: JGAD000948
- 総データ量
JGAD000747: 69.2 GB(fastq) JGAD000948: 46.9 GB(fastq)
- 利用ポリシー